Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  189  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62040070--62040392
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3.4
94
93
2
529
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8
30
29
1.86
62040070--62040392
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2.3
143
94
1
560
32
8
30
29
1.86
62040511--62040589
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2.1
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0
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0
50
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0
0
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0.63
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200
35
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22
25
1.95
62047518--62047809
140
2.1
138
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2
415
30
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20
27
1.98
62050581--62050643
27
2.3
27
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39
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17
1.75
62051152--62051185
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0
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1
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1.98
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1.9
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92
0
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5.7
40
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25
22
27
24
2.00
62102725--62102765
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2.6
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0
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0
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0
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29
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32
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62102750--62103195
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687
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29
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1.87
62107592--62107780
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4.7
40
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326
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22
27
24
2.00
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2.7
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94
0
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12
1.90
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4.9
49
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179
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28
18
27
1.98
62111781--62111950
94
1.8
93
83
5
227
24
27
18
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1.98
62113331--62113361
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5.3
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55
0
16
0
83
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5
7.2
5
96
3
63
40
0
42
17
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62120518--62120556
21
1.9
20
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5
51
61
5
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15
1.51
62122952--62122988
18
2.1
18
89
0
56
18
24
13
43
1.86
62123122--62123168
18
2.6
18
93
6
78
17
44
4
34
1.68
62124422--62125061
223
2.8
224
83
4
752
29
15
15
38
1.89
62124882--62125303
126
3.4
125
81
6
455
31
15
13
40
1.85
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22
2.3
22
100
0
100
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0
12
1.30
62125440--62125518
33
2.6
28
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24
72
43
10
1
45
1.45
62125531--62125576
22
2.1
22
83
0
56
45
28
4
21
1.71
62129309--62129356
16
3.1
16
82
11
64
60
8
2
29
1.37
62129309--62129349
14
2.7
15
85
11
57
58
9
0
31
1.31
62130983--62131012
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2.0
15
93
0
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16
6
3
73
1.18
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94
3.8
94
79
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352
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20
30
22
1.99
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44
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47
78
10
156
23
19
29
26
1.98
62140380--62140595
49
4.6
48
74
10
153
26
20
29
23
1.99
62140286--62140595
47
6.6
47
70
14
185
26
21
29
23
1.99
62154882--62154990
53
2.1
53
94
0
191
19
11
13
55
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19
6.2
21
84
10
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36
17
9
36
1.83
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19
6.2
19
94
6
202
35
16
10
37
1.82
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55
2.0
57
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208
36
15
10
37
1.82
62160950--62161075
55
2.3
54
89
10
193
35
15
10
38
1.82
62160949--62161065
36
3.1
38
92
7
202
35
16
10
37
1.82
62161454--62161965
206
2.5
206
91
1
803
28
22
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
106
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0
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16
33
1.95
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312
2.0
311
92
0
1039
28
21
17
31
1.96
62162271--62162434
44
3.7
44
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6
143
27
24
17
30
1.97
62163275--62163327
25
2.1
25
82
10
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7
16
0
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1.02
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2.2
17
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0
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5
10
0
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0.77
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11
0
83
0.78
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19
2.3
19
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2
11
0
86
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17
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12
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3
12
0
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1.84
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19
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16
10
36
1.82
62168204--62168301
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2.6
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144
36
16
10
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0
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2
2
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1.07
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1.53
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16
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1.23
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100
0
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0
12
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16
33
1.73
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2.1
19
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2
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1.55
62185214--62185254
18
2.3
18
83
8
57
24
14
31
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62187255--62187298
22
2.0
22
100
0
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50
4
27
18
1.66
62191216--62191257
22
1.9
22
85
0
57
59
0
4
35
1.19
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18
1.9
17
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5
50
29
2
0
67
1.05
62196265--62196336
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3.4
22
67
21
71
51
13
8
26
1.70
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2.0
42
100
0
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50
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8
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1.71
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103
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0
376
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19
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33
1.80
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23
2.0
22
87
4
65
28
2
0
69
1.00
62200512--62200546
15
2.2
16
95
5
63
48
17
0
34
1.47
62202095--62202256
3
51.7
3
81
12
103
59
0
40
0
0.98
62202143--62202209
14
4.7
14
87
8
100
68
0
31
0
0.90
62209129--62209190
29
2.1
29
87
0
88
46
6
33
12
1.68
62219624--62219673
24
2.1
24
88
3
75
66
2
14
18
1.35
62226467--62226528
21
2.9
20
72
11
52
35
11
8
45
1.70
62226510--62226553
21
2.1
21
83
8
54
34
9
2
54
1.44
62229322--62229368
23
2.0
23
100
0
94
23
25
25
25
2.00
62246961--62246990
15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
62246957--62247019
27
2.3
26
76
10
63
38
0
11
50
1.38
62247015--62247046
10
3.3
10
95
4
57
37
0
0
62
0.95
62247014--62247057
20
2.3
19
80
4
52
36
0
2
61
1.09
62261084--62261182
27
3.5
28
90
2
137
27
13
28
31
1.94
62261112--62261195
27
3.0
28
85
5
107
30
11
23
33
1.91
62273273--62273484
40
5.3
40
86
3
268
23
20
27
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62281663--62281871
40
5.3
40
86
5
250
23
20
27
28
1.99
62290698--62290730
13
2.6
13
90
4
50
54
9
0
36
1.32
62293657--62293690
6
5.7
6
100
0
68
85
0
0
14
0.60
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18
1.9
18
88
0
52
54
8
17
20
1.68
62304295--62304361
27
2.5
26
81
9
82
37
22
20
19
1.95
62304561--62304625
22
3.0
22
80
8
78
30
23
26
20
1.98
62305014--62305370
27
13.2
27
85
4
445
26
18
18
36
1.94
62307513--62307546
12
2.8
12
83
16
52
41
0
5
52
1.25
62312654--62312892
27
8.9
26
86
6
282
34
23
23
18
1.96
62312672--62312892
81
2.7
82
90
4
351
34
23
23
18
1.96
62314513--62314620
26
4.2
26
96
0
198
36
25
6
31
1.82
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27
2.0
27
85
7
72
32
26
24
16
1.97
62324209--62324251
22
2.0
22
95
0
77
27
27
27
16
1.97
62324497--62324579
27
3.1
27
78
3
87
30
19
20
30
1.97
62324822--62324859
19
2.0
19
90
10
60
26
44
18
10
1.82
62328264--62328439
27
6.5
26
82
6
156
26
15
29
28
1.96
62328264--62328419
82
1.9
81
85
3
215
26
16
30
27
1.96
62328264--62328439
54
3.2
55
80
6
173
26
15
29
28
1.96
62328260--62328439
82
2.2
81
81
3
209
26
16
28
28
1.97
62332815--62332867
26
2.0
26
85
7
72
32
28
20
18
1.97
62333294--62333359
27
2.4
27
80
5
71
28
18
18
34
1.94
62339535--62339722
41
4.5
41
89
2
268
36
23
19
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62340016--62340063
21
2.3
21
92
0
78
2
58
18
20
1.49
62343755--62343780
12
2.2
12
100
0
52
30
26
7
34
1.85
62345613--62345766
9
16.1
9
75
11
137
30
0
22
46
1.56
62345615--62345723
57
1.9
57
90
0
173
29
0
23
45
1.59
62345646--62345762
39
3.0
39
97
0
216
31
0
21
47
1.51
62347238--62347607
183
2.0
184
96
0
688
42
14
15
27
1.86
62347678--62347707
14
2.2
13
94
5
51
36
13
0
50
1.42
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28
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10
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0
27
1.56
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2.6
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3
72
41
30
0
28
1.56
62350428--62350577
49
3.0
49
83
9
194
42
30
0
27
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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