Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  243  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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22
25
2.00
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Indices
Period
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Copy
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Score
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27
27
1.99
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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24
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20
4
47
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
29
1.99
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33
4
0
62
1.15
80285155--80285290
10
13.9
9
69
17
67
34
3
2
59
1.27
80285213--80285290
19
4.2
18
70
15
61
34
2
2
60
1.24
80285216--80285290
27
2.6
29
83
8
100
33
2
2
61
1.24
80285267--80285365
27
3.4
28
71
14
74
36
5
3
55
1.37
80287464--80288173
234
3.0
234
98
0
1366
34
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37
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48
2
0
48
1.14
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14
2.9
14
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11
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60
0
0
40
0.97
80288446--80288485
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3.0
13
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3
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0
0
40
0.97
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2
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1.20
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20
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0
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49
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23
1.75
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47
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47
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2
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33
9
29
27
1.88
80302195--80302793
96
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93
2
882
33
9
29
27
1.88
80302644--80302765
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5.3
22
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21
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33
11
29
25
1.91
80306707--80306745
19
2.0
20
90
5
62
25
0
28
46
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
127
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2
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34
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17
31
1.92
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2.4
133
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2
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28
26
17
28
1.97
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177
2.1
177
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5
433
25
28
17
28
1.97
80312107--80312203
44
2.2
45
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110
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25
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310
2.1
309
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4
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27
17
28
1.98
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2.9
178
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26
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2.0
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0
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20
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1.78
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83
43
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0
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3
11.3
3
100
0
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0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80354643--80354677
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0
0
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0
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1.20
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0
0
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1
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0
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0
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6
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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