Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  3  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
605570--605609
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1.9
21
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10
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32
0
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0
0
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0
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3.0
30
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10
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1.9
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4.9
46
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314
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1.91
637475--638780
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1
1993
26
24
21
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2.1
614
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1
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26
24
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0
13
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20
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24
2.4
24
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3
60
62
0
1
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650471--650516
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24
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0
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63
0
0
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2.3
15
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0
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58
8
14
17
1.61
655559--656226
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15.4
43
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246
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1.99
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5.7
130
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0
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24
20
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7.4
86
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319
26
25
20
28
1.99
656207--656402
95
2.0
96
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358
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18
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3.0
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1
539
28
22
19
29
1.98
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327
2.0
327
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1
1187
28
22
20
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
656968--657300
46
7.4
46
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11
150
29
23
21
26
1.99
656862--657367
135
3.7
135
96
0
897
28
22
20
28
1.99
657267--657749
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5.0
95
95
1
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29
22
18
29
1.97
657554--658023
231
2.0
230
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1
852
29
23
18
28
1.98
657787--657946
45
3.4
45
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17
117
28
25
17
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1.97
657785--657980
97
2.0
95
95
1
347
28
23
18
29
1.98
657971--658147
86
2.0
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284
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23
22
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2.00
658004--658143
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3.2
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23
24
25
2.00
663967--664016
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2.8
17
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11
0
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57
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4
2
70
1.15
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2.0
85
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1
295
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1.78
683524--683635
41
2.7
41
94
0
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25
20
1.99
684198--684246
24
2.0
24
100
0
98
53
0
4
42
1.20
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24
2.0
24
83
4
60
25
37
4
33
1.75
687810--687896
18
4.8
18
88
0
120
28
22
14
33
1.94
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47
10.4
47
90
4
701
26
29
9
33
1.89
699321--699503
43
4.3
43
88
1
260
25
17
28
28
1.97
699321--699503
85
2.1
86
89
1
278
25
17
28
28
1.97
703364--703423
30
2.0
30
93
0
102
43
6
21
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1.78
703800--704100
153
1.9
155
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7
389
40
15
17
26
1.90
704135--704189
27
2.0
27
92
0
92
38
18
12
30
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
705465--705518
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2.2
24
83
0
63
42
7
12
37
1.72
712159--712192
17
2.0
17
94
0
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44
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0
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1.26
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2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
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1.9
28
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11
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13
9
21
1.67
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0
174
39
0
0
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2.1
18
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9
51
61
0
2
35
1.10
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4.3
6
100
0
52
19
15
15
50
1.79
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47
3.8
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81
14
234
29
26
20
23
1.99
727690--727861
94
1.8
93
92
3
292
29
26
20
23
1.99
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2.0
30
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2.0
67
97
0
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17
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1.97
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159
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18
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1.97
737249--737328
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1.9
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7
119
22
26
31
20
1.98
751641--751724
41
2.0
43
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127
35
9
20
34
1.85
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13
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0
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136
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20
34
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0
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0
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26
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2.0
19
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0
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28
2.3
27
84
13
83
30
11
9
49
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
793846--793880
4
8.8
4
93
0
61
48
22
0
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1.51
794000--794047
4
12.0
4
95
0
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47
25
2
25
1.62
793846--794166
167
1.9
168
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3
477
35
28
4
31
1.78
794383--794411
13
2.1
14
93
6
51
68
31
0
0
0.89
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2.4
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1
229
35
19
15
29
1.93
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30
2.9
30
80
14
99
32
5
3
58
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2.4
21
100
0
100
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20
16
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21
15
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0
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30
4.1
30
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1
194
43
6
23
26
1.78
824698--824751
20
2.7
20
82
0
63
24
20
18
37
1.94
824698--824771
30
2.5
30
86
8
98
21
20
18
39
1.93
824698--824762
20
3.2
20
71
16
53
23
21
16
38
1.93
828874--828951
15
5.2
15
67
11
61
44
7
21
25
1.79
828870--828951
30
2.7
30
94
0
137
46
7
21
24
1.77
834229--834253
6
4.2
6
100
0
50
84
0
0
16
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19
2.2
20
87
4
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30
18
4
46
1.69
848518--848571
27
1.9
29
92
7
94
33
0
1
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1.04
848526--848589
27
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25
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24
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0
1
60
1.06
848875--848903
3
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3
100
0
58
68
0
31
0
0.89
849917--850035
60
2.0
60
84
0
157
35
2
10
51
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
850122--850199
28
2.7
28
71
11
77
24
6
12
56
1.60
856062--856107
24
2.0
23
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4
74
19
15
17
47
1.82
856167--856246
27
3.0
27
81
0
97
25
30
25
20
1.99
856282--856339
27
2.1
27
87
6
82
68
1
0
29
0.99
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479
2.0
477
97
0
1817
38
12
14
34
1.84
857936--857993
19
3.2
18
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9
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1
0
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1.06
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3.6
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0
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1.87
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2.5
73
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0
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40
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1.80
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3
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0
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0
0
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3
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0
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0
0
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4.3
68
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0
374
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21
25
25
2.00
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6
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32
18
16
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1.94
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78
4.6
78
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9
452
30
19
17
32
1.95
882732--882819
18
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17
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28
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63
0
10
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1.26
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17
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0
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1.23
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3
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3
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2
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1.44
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1.9
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12
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0
11
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41
2.3
41
83
9
111
62
4
5
27
1.35
882855--882893
20
2.0
20
89
0
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2
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1.25
883080--883157
28
2.8
27
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7
93
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2
8
24
1.36
888177--888281
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2.3
46
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0
165
43
7
26
21
1.79
891657--891681
12
2.1
12
100
0
50
16
8
0
76
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
891669--891718
20
2.8
17
77
16
55
24
6
2
68
1.23
893990--894083
23
4.1
23
85
0
134
22
25
4
47
1.69
898496--898589
23
4.1
23
85
0
134
22
25
4
47
1.69
901980--902217
43
5.6
43
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3
223
32
27
16
23
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2.1
23
84
3
62
52
29
4
14
1.60
908295--908349
19
3.0
19
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15
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3
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14
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2
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22
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924005--924045
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20
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0
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924084--924117
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8.2
4
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6
50
70
0
29
0
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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