Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  37  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
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0
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33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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158
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15
24
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10486219--10486287
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16
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15
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25
87
4
71
63
0
0
36
0.95
10507359--10507388
14
2.1
14
93
0
51
33
6
3
56
1.42
10507449--10507474
13
2.0
13
100
0
52
53
0
0
46
1.00
10507455--10507511
16
3.9
15
73
19
57
54
0
1
43
1.10
10511302--10511342
21
2.0
21
90
0
64
21
29
19
29
1.98
10516345--10516410
31
2.1
32
83
8
82
43
7
3
45
1.47
10527667--10527701
9
3.9
9
96
0
61
0
42
2
54
1.15
10527666--10527722
3
19.0
3
75
7
53
1
35
1
61
1.17
10528435--10528476
19
2.3
18
84
8
57
23
0
4
71
1.05
10531936--10531976
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
10533882--10533915
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
10534079--10534115
13
2.8
13
100
0
74
0
32
5
62
1.18
10536967--10537004
19
2.1
19
85
9
53
55
2
2
39
1.28
10541646--10541675
13
2.3
13
94
0
51
36
26
0
36
1.57
10541759--10541988
46
5.0
46
91
1
318
22
23
13
40
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10542542--10542660
55
2.2
55
95
3
213
34
13
4
47
1.62
10543462--10543494
11
3.1
11
82
8
50
9
30
0
60
1.27
10545195--10545276
25
3.3
25
92
0
137
29
24
21
24
1.99
10548918--10548978
6
9.5
6
75
10
50
75
6
1
16
1.09
10556617--10556659
21
2.0
21
100
0
86
34
9
18
37
1.83
10558600--10558628
11
2.7
11
94
5
51
82
0
0
17
0.66
10563004--10563032
11
2.7
11
94
5
51
82
0
0
17
0.66
10565921--10565949
11
2.6
11
100
0
58
37
17
0
44
1.49
10569215--10569306
45
2.0
45
100
0
184
21
21
17
39
1.93
10573441--10573552
37
3.0
37
97
0
206
20
25
22
32
1.98
10581673--10581730
19
3.1
18
80
9
64
63
3
3
29
1.27
10581636--10581730
37
2.5
37
80
8
102
62
3
2
32
1.23
10581854--10581893
21
1.9
21
84
0
53
62
2
2
32
1.22
10582237--10582277
10
3.9
10
93
6
64
36
0
0
63
0.95
10582257--10582303
13
3.6
13
80
8
51
21
0
4
74
0.99
10582691--10582743
22
2.4
22
87
0
70
26
5
37
30
1.79
10592815--10592853
18
2.2
18
85
0
51
7
12
10
69
1.37
10592912--10592947
18
1.9
19
88
5
56
66
19
2
11
1.35
10596801--10596933
45
3.0
45
87
0
176
24
17
27
30
1.97
10597799--10597835
2
18.5
2
94
0
65
2
0
45
51
1.15
10607047--10607080
17
1.9
18
94
5
61
0
29
38
32
1.58
10610604--10610730
55
2.3
56
87
5
197
14
31
29
23
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10611732--10611822
40
2.3
41
82
5
114
30
26
15
27
1.96
10617525--10617723
55
3.6
56
86
2
280
17
31
28
22
1.96
10618579--10618620
19
2.2
19
95
0
75
35
19
0
45
1.50
10618715--10618807
40
2.3
40
83
5
118
29
25
15
30
1.95
10630870--10630910
20
2.0
21
85
4
57
48
0
9
41
1.36
10631373--10631399
9
3.0
9
100
0
54
77
0
0
22
0.76
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2.8
18
80
11
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45
5
0
49
1.26
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20
2.1
20
86
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2
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65
1.25
10639783--10639837
20
2.8
19
81
8
56
25
1
3
69
1.15
10652564--10652592
14
2.1
14
100
0
58
44
13
0
41
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333