Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  45  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12906452--12906588
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12906502--12906598
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3.0
30
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15
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1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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30
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2
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2
146
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0
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3
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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117
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22
44
13
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13050230--13050334
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1.84
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2.0
103
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2.0
25
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5.7
46
74
15
260
20
18
29
30
1.97
13091823--13092086
92
2.8
93
95
0
458
20
18
30
30
1.96
13096464--13096500
18
2.1
18
94
0
65
27
2
0
70
1.01
13097037--13097066
15
2.0
15
93
0
51
66
3
0
30
1.07
13101023--13101098
22
3.7
21
76
15
68
40
17
6
35
1.75
13101052--13101149
35
2.7
37
87
12
150
35
16
10
37
1.82
13101059--13101149
19
4.9
19
92
8
161
36
15
10
37
1.83
13110922--13111086
35
4.7
35
82
1
188
30
10
25
33
1.90
13113734--13113776
19
2.3
19
91
0
68
30
9
30
30
1.88
13118279--13118443
35
4.7
35
87
1
224
31
12
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1.92
13121589--13121648
31
1.9
31
89
0
93
16
23
18
41
1.90
13125926--13125954
14
2.0
15
93
6
51
58
0
0
41
0.98
13132433--13132545
23
5.1
22
73
10
81
30
1
1
65
1.13
13132508--13132564
7
8.0
7
75
11
53
36
1
1
59
1.18
13132508--13132546
15
2.6
15
84
11
53
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13132698--13132745
20
2.4
19
80
16
53
27
6
4
62
1.38
13133132--13133180
24
2.0
26
84
8
66
32
6
4
57
1.42
13138141--13138371
43
5.3
43
91
4
342
26
16
32
25
1.96
13138149--13138371
87
2.6
86
93
2
385
25
15
32
26
1.95
13138141--13138391
130
1.9
129
86
2
351
25
17
31
25
1.97
13138466--13138548
31
2.6
31
80
3
85
61
19
3
15
1.48
13144419--13144546
9
13.6
9
75
9
112
30
2
21
46
1.64
13144423--13144546
39
3.3
36
76
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117
29
2
20
46
1.64
13144419--13144546
57
2.2
57
83
0
157
30
2
21
46
1.64
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241
4.8
241
98
0
2199
32
15
17
34
1.91
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23
2.2
23
100
0
100
34
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16
34
1.90
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2.0
45
82
4
112
38
25
6
28
1.81
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29
1.9
29
85
7
78
26
0
23
50
1.50
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41
6.6
40
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7
247
25
17
23
33
1.96
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2.2
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165
42
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15
33
1.78
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7
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55
0
0
44
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43
3.9
44
78
5
169
27
13
24
33
1.93
13160087--13160131
24
2.0
22
82
8
54
44
2
26
26
1.66
13161792--13161850
21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
69
1.15
13161821--13161870
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
64
1.18
13163656--13163737
26
3.2
26
100
0
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30
7
26
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1.84
13166439--13166470
16
2.0
16
93
0
55
59
12
3
25
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13170743--13170824
26
3.2
26
100
0
164
30
7
26
35
1.84
13173525--13173555
16
1.9
16
93
0
53
61
12
3
22
1.46
13177617--13177641
11
2.3
11
100
0
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0
0
28
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1.9
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10
86
28
20
0
50
1.48
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27
2.6
29
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8
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1.68
13187762--13187786
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10
100
0
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100
0
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20
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1.83
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2.0
21
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29
2
2
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1.18
13198855--13198943
35
2.5
35
80
3
99
20
23
25
30
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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