Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  191  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62575100--62575198
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52
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1.44
62575200--62575387
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0
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120
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21
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27
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2.0
23
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4.3
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27
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24
1.99
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1.9
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224
27
27
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24
1.99
62603307--62603531
80
2.8
78
81
4
243
27
28
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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23
1.99
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11
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1.96
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2.0
22
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2.7
22
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0
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10
1.89
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48
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30
15
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1.96
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38
2.0
38
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0
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28
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2.3
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1.94
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28
21
27
1.99
62625827--62626187
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3.9
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28
21
27
1.99
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3.9
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1.95
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4.0
44
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15
26
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1.95
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40
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263
24
27
21
25
1.99
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1.9
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82
10
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26
28
20
24
1.99
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40
6.7
40
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7
254
24
28
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25
1.99
62653671--62653880
79
2.7
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253
24
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2.6
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0
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0
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0
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16
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6
60
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2.1
118
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16
29
23
1.96
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21
2.0
20
86
13
57
19
2
24
53
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62681385--62681409
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1.9
13
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0
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4
24
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2.0
17
88
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2.1
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34
1.61
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4.7
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22
24
2.00
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214
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27
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25
2.00
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216
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1.99
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210
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29
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23
22
28
25
1.99
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1.73
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2.0
22
95
0
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38
22
20
18
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62766208--62766276
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0
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18
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1.88
62770807--62770860
22
2.4
23
82
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12
27
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11
1
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1.51
62771837--62771888
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20
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11
1
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1.51
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50
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0
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16
3.2
16
68
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52
56
9
13
19
1.65
62787186--62787249
31
2.1
31
96
0
119
48
12
17
21
1.80
62791390--62791572
79
2.3
80
83
7
221
24
27
22
24
2.00
62791388--62791572
40
4.7
40
82
7
225
24
28
22
24
2.00
62795212--62795340
61
2.2
58
83
6
152
49
6
2
41
1.42
62795266--62795408
68
2.0
71
81
7
168
51
5
1
41
1.34
62798419--62798505
35
2.5
35
77
5
97
22
22
20
33
1.97
62798357--62798665
143
2.2
143
79
2
368
24
22
21
32
1.98
62802905--62802939
15
2.2
16
90
5
54
40
0
0
60
0.97
62813030--62813063
15
2.3
15
89
0
50
55
0
11
32
1.36
62814541--62814611
27
2.7
26
75
12
74
69
7
11
12
1.37
62814637--62814674
17
2.1
19
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9
62
73
0
7
18
1.06
62814657--62814684
10
2.8
10
100
0
56
75
0
7
17
1.03
62814638--62814688
15
3.5
15
74
20
54
72
0
7
19
1.08
62814916--62815095
3
62.0
3
74
10
133
62
2
6
28
1.33
62816152--62816201
14
3.2
16
79
20
61
10
0
34
56
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62816557--62816760
44
4.4
44
71
15
142
27
24
20
28
1.99
62816588--62816822
98
2.4
98
88
1
337
29
22
18
28
1.97
62816610--62816867
98
2.6
97
82
4
320
29
21
18
29
1.97
62816696--62817481
143
5.5
143
87
1
1058
28
21
19
30
1.98
62817084--62817188
44
2.4
44
80
1
111
26
25
20
27
1.99
62817118--62817471
44
7.5
44
64
14
116
28
22
18
29
1.98
62817503--62817603
44
2.3
44
79
3
105
32
21
14
30
1.94
62817581--62817623
21
2.0
21
90
0
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25
32
9
32
1.88
62817540--62817668
65
2.0
65
84
6
172
29
24
15
30
1.96
62817698--62817903
89
2.3
89
77
5
211
26
23
19
30
1.98
62820499--62820722
39
5.7
39
89
3
317
24
20
24
30
1.99
62820499--62820722
78
2.9
78
91
0
358
24
20
24
30
1.99
62820499--62820722
117
1.9
117
90
0
358
24
20
24
30
1.99
62829185--62829222
19
2.0
19
100
0
76
26
31
5
36
1.79
62830879--62830912
15
2.3
15
90
10
52
67
2
8
20
1.31
62830941--62831000
22
2.8
21
82
7
66
78
1
6
13
1.02
62830970--62831014
15
2.7
17
86
10
58
77
0
4
17
0.92
62831028--62831060
4
8.2
4
100
0
66
75
0
0
24
0.80
62831915--62832041
46
2.7
47
85
6
168
28
20
31
19
1.97
62832035--62832059
13
1.9
13
100
0
50
24
16
32
28
1.96
62831989--62832099
59
1.9
58
83
9
145
27
18
29
24
1.98
62836065--62836144
28
2.9
28
77
5
90
22
26
18
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62846505--62846671
47
3.6
47
75
12
134
28
19
28
23
1.98
62846638--62846767
50
2.7
46
81
8
143
30
18
26
25
1.98
62853679--62853724
20
2.2
20
84
3
56
26
26
13
34
1.92
62857163--62857204
20
2.1
20
100
0
84
35
14
14
35
1.86
62860158--62860193
17
2.1
17
100
0
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36
11
16
36
1.84
62861729--62861784
22
2.5
23
77
8
62
46
5
16
32
1.69
62864908--62865181
46
6.0
46
92
0
379
20
24
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1.90
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4.0
175
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0
1338
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10
40
1.84
62869429--62869731
96
3.2
97
83
7
379
24
29
18
28
1.98
62869429--62869731
144
2.1
144
84
6
391
24
29
18
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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