Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  22  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6601771--6602005
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7
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9
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28
1
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1.60
6607646--6607677
7
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100
0
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1.85
6607735--6607855
9
13.6
9
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1
17
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1.58
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2.8
26
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2
92
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2
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1.57
6607972--6608014
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20
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4
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60
2
0
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1.10
6608538--6608599
23
2.7
23
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2
90
41
9
1
46
1.46
6609231--6609297
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2.6
25
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2
71
32
14
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1.86
6613150--6613293
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1.97
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2.8
40
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27
18
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6622770--6622850
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2.2
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8
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2
25
1.66
6623002--6623047
21
2.2
21
84
0
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26
0
21
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87
28
0
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48
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21
2.3
23
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13
59
30
0
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44
1.54
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14
3.9
15
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9
53
29
0
21
49
1.50
6623366--6623549
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4.4
41
70
15
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18
20
38
1.94
6625965--6626021
7
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7
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7
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40
0
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1.49
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23
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5
22
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6626176--6626695
230
2.3
229
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2
857
34
5
22
38
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6626772--6626830
24
2.5
22
84
13
73
35
6
25
32
1.82
6626176--6626871
230
3.0
230
86
5
752
33
5
22
37
1.77
6627525--6627690
42
3.9
42
88
0
224
21
19
28
30
1.98
6628432--6628505
36
2.1
36
86
0
103
25
20
24
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6630417--6630451
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1.9
18
94
0
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31
17
22
28
1.96
6631732--6631767
4
9.0
4
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11
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0
0
25
0.81
6633115--6633167
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
6633162--6633213
27
1.9
27
88
0
77
7
26
1
63
1.32
6642599--6642626
2
14.0
2
100
0
56
50
0
50
0
1.00
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2
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0
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0
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45
1.17
6643334--6643380
20
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13
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0
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6643334--6643380
17
2.5
19
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10
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0
0
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71
4
23
0
1.03
6655512--6655564
19
3.0
17
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15
54
39
5
15
39
1.70
6655536--6655598
22
2.9
21
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63
36
3
19
41
1.67
6658611--6658637
5
5.4
5
100
0
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0
40
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3
6
38
1.45
6661854--6662169
125
2.5
125
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1
454
36
17
17
28
1.93
6667571--6667620
11
4.9
10
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11
66
42
0
28
30
1.56
6667571--6667621
21
2.4
21
87
9
68
41
0
29
29
1.57
6672287--6672457
66
2.6
66
82
5
202
31
26
14
27
1.95
6672392--6672466
30
2.5
30
84
4
98
29
21
18
30
1.97
6676472--6676680
107
2.0
106
91
2
339
27
21
19
31
1.97
6690972--6691062
45
2.0
45
95
0
164
43
15
8
31
1.77
6693088--6693524
18
24.6
18
68
20
106
44
10
11
33
1.75
6693094--6693158
16
3.9
16
78
15
53
49
10
13
26
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6693258--6693533
17
15.4
17
71
11
140
45
10
12
32
1.75
6693278--6693360
22
4.1
21
80
11
86
42
8
7
42
1.63
6693478--6693533
18
3.1
19
76
7
62
41
14
10
33
1.80
6693528--6693578
18
2.9
17
77
8
57
47
7
9
35
1.66
6694083--6694132
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6.9
7
93
6
82
0
16
0
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15
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92
0
17
0
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0.67
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22
3.5
21
82
10
82
0
17
0
82
0.67
6694073--6694148
14
5.5
13
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7
71
0
17
0
82
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3
15.0
3
82
13
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0
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3.9
13
75
24
52
0
36
0
63
0.95
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10
100
0
58
0
37
0
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7
59
0
30
0
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19
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11
63
0
30
0
69
0.88
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30
3.9
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11
94
44
3
21
30
1.69
6694841--6694942
30
3.4
30
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2
125
44
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21
30
1.70
6694940--6694973
15
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16
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52
20
0
2
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0.92
6694940--6694973
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16
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0
50
20
0
2
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0.92
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4.7
54
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6
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35
18
15
30
1.92
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2.5
13
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0
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15
1.36
6695591--6697264
72
23.1
72
95
1
2893
33
18
17
30
1.94
6695591--6697264
145
11.6
144
95
1
2893
33
18
17
30
1.94
6695591--6697252
217
7.6
217
96
0
2972
33
18
17
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6698194--6698306
46
2.5
45
78
5
113
13
25
15
45
1.83
6705492--6705931
18
24.6
18
68
20
110
44
10
11
33
1.74
6705498--6705563
16
3.9
16
78
13
53
48
10
13
27
1.75
6705684--6705767
22
4.1
21
83
10
95
44
8
7
40
1.62
6705764--6705817
16
3.2
16
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14
56
40
9
14
35
1.78
6705746--6705822
34
2.3
34
88
4
111
46
7
12
32
1.71
6705891--6705939
18
2.6
19
77
6
55
46
16
12
24
1.81
6705935--6705985
18
2.9
17
77
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57
47
7
9
35
1.66
6706480--6706545
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8.4
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90
10
84
0
18
0
81
0.68
6706482--6706558
14
5.1
15
83
10
86
0
18
0
81
0.68
6706491--6706541
15
3.4
15
91
5
77
0
15
0
84
0.63
6706487--6706558
23
3.2
22
86
7
92
0
18
0
81
0.68
6706694--6706724
16
1.9
16
93
0
53
3
6
12
77
1.08
6706687--6706712
11
2.4
11
100
0
52
0
11
7
80
0.89
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3
15.0
3
82
13
58
0
36
0
63
0.95
6706860--6706888
10
2.9
10
100
0
58
0
37
0
62
0.96
6706846--6706891
13
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13
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18
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0
36
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63
0.95
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10
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10
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59
0
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0
70
0.88
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19
2.3
19
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11
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0
30
0
69
0.88
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30
3.9
29
77
11
94
44
3
21
30
1.69
6707257--6707358
30
3.4
30
83
2
125
44
3
21
30
1.70
6707356--6707393
18
2.1
19
90
5
60
18
0
2
78
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6707356--6707393
19
2.0
19
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0
58
18
0
2
78
0.86
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32
2.0
32
93
0
110
20
51
17
10
1.75
6722374--6722418
22
2.0
22
95
0
81
44
2
13
40
1.56
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28
2.6
28
84
8
85
44
0
4
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1.20
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2.0
17
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0
2
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1.15
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27
2.7
27
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0
4
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1.20
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45
2.1
45
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1
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32
27
5
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1.79
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16
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16
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14
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17
6
6
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3.8
131
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20
17
32
1.95
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18
2.0
18
100
0
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16
27
22
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1.95
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21
2.5
21
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11
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70
1
3
24
1.13
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3
20.3
3
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0
113
31
0
1
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1.01
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21
2.0
21
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0
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19
7
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46
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30
15
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21
2.0
21
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73
21
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0
108
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21
2.1
21
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0
72
24
6
22
46
1.75
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42
2.3
42
85
0
122
36
15
31
16
1.90
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155
2.0
155
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568
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14
2.0
15
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51
31
0
0
68
0.89
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8
4.9
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81
12
53
35
0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6755267--6755300
15
2.2
16
89
5
52
35
0
0
64
0.94
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17
1.9
17
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11
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18
0
9
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1.10
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14
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5
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57
2
0
40
1.10
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2.0
20
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0
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20
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16.0
3
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11
59
67
0
32
0
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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