Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  262  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86586610--86586697
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25
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23
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26
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23
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1.94
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3.9
43
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31
14
23
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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1.88
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86733826--86733975
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223
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22
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1.99
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2.3
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29
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24
18
28
28
1.98
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21
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2.3
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26
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1.94
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77
15
127
26
26
13
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
23
28
25
1.99
86781261--86781523
120
2.2
120
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368
21
23
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1.99
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16
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1.97
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104
37
21
20
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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20
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27
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18
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19
18
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8
22
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1.82
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40
1.82
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21
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1.82
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108
2.9
106
84
6
347
29
9
21
40
1.84
86812140--86812287
44
3.4
44
74
7
138
30
18
23
27
1.98
86816537--86816566
8
3.8
8
100
0
60
40
0
0
60
0.97
86816537--86816575
8
4.8
9
93
6
50
43
0
0
56
0.99
86816614--86816659
23
2.0
23
83
8
58
45
4
10
39
1.59
86817668--86817784
40
2.9
39
83
3
135
38
11
17
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1.85
86818903--86818942
21
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21
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0
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62
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2
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1.22
86833650--86833734
40
2.1
40
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4
118
34
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20
25
1.96
86847635--86848012
99
3.9
99
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2
505
35
7
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37
1.80
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14
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15
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0
0
52
1.00
86852143--86852309
82
2.0
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10
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5
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0
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18
1.91
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18
2.6
18
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2
0
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1.06
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8
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9
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0
0
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0
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42
0
0
57
0.98
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16
2.1
17
88
5
52
67
0
2
29
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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0
1
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1.00
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33
0
0
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0.92
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48
3.6
48
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6
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31
17
26
23
1.97
86876917--86877136
46
4.7
47
76
5
194
30
18
26
24
1.98
86876959--86877136
94
1.9
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3
261
31
17
26
23
1.97
86878332--86878396
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2.3
28
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0
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16
20
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1.87
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1.45
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56
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2.0
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1.58
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21
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0
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26
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27
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135
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6
5.0
6
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0
51
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16
16
20
1.84
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29
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1.97
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17
2.1
17
89
0
54
47
8
8
36
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86974172--86974435
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5.7
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0
366
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24
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1.9
20
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51
8
0
40
1.32
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172
2.0
172
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1
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20
4.2
20
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47
20
17
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1.83
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2.2
25
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2.0
18
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0
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380
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1.98
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2.6
151
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0
635
27
18
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86993382--86993413
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2.0
16
93
0
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46
0
18
34
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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