Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  269  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88830365--88830536
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15
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28
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2.0
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0
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25
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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1.84
88908272--88908338
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2.2
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22
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1.9
138
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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18
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14
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1.87
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2.1
28
96
0
107
32
20
3
43
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88991506--88991543
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2.9
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51
18
7
0
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1.06
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2.9
19
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0
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14
9
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1.14
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31
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1.71
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75
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15
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61
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209
36
14
21
27
1.92
89014112--89014373
76
3.5
74
87
2
362
31
16
21
29
1.96
89014445--89014712
77
3.5
77
78
11
264
31
14
19
33
1.92
89015216--89015257
15
2.6
17
88
7
61
64
14
7
14
1.48
89015219--89015257
17
2.4
17
86
4
53
66
12
5
15
1.41
89016014--89016074
17
3.8
17
78
18
60
36
6
3
54
1.43
89020487--89020520
18
1.9
18
88
5
52
55
2
2
38
1.30
89020816--89020890
23
3.1
24
75
12
73
52
0
2
45
1.15
89020827--89020901
36
2.1
36
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5
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49
0
1
49
1.09
89021589--89021620
4
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4
100
0
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0
0
25
0.81
89024867--89024917
11
4.8
11
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18
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0
7
27
1.21
89025065--89025129
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47
1
0
50
1.10
89025044--89025099
30
2.0
27
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10
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1
0
57
1.09
89025257--89025283
10
2.7
10
100
0
54
59
0
0
40
0.98
89025286--89025350
14
4.5
14
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5
58
38
0
0
61
0.96
89026891--89026967
36
2.1
36
83
9
95
54
2
5
37
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89029303--89029362
28
2.1
30
84
12
81
65
5
6
23
1.37
89035656--89035748
18
5.2
18
85
0
123
33
15
22
29
1.94
89035656--89035748
36
2.6
36
87
0
141
33
15
22
29
1.94
89043385--89043410
6
4.3
6
100
0
52
80
0
0
19
0.71
89061075--89061141
30
2.3
29
85
7
91
29
0
11
58
1.34
89062001--89062034
3
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3
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0
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0
0
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0.94
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0
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0
0
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0.68
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1.9
100
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0
270
25
23
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31
1.98
89070193--89070974
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4.4
177
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3
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26
23
19
30
1.98
89070193--89070999
353
2.3
353
85
3
1068
26
23
19
31
1.98
89071172--89071425
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4.0
64
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1
341
37
14
17
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1.90
89071456--89071482
14
1.9
14
100
0
54
25
7
7
59
1.51
89072521--89072572
14
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14
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5
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5
9
1
82
0.90
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1.9
23
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4
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69
9
2
18
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19
2.0
20
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51
5
5
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1.19
89095752--89095793
19
2.2
19
83
8
50
73
7
0
19
1.05
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27
2.8
28
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17
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64
7
1
27
1.28
89095730--89095834
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2.2
50
78
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123
62
4
0
31
1.22
89095730--89095833
9
10.9
9
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11
75
63
4
0
30
1.21
89095731--89095832
29
3.6
28
74
13
75
64
4
0
29
1.20
89111716--89111754
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2.8
14
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0
69
46
0
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1.42
89112220--89112271
15
3.2
15
73
19
50
44
0
1
53
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89112339--89112380
20
2.0
22
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61
54
0
0
45
0.99
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9
18.9
9
65
22
65
60
3
0
35
1.14
89114302--89114415
17
6.5
17
75
16
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61
1
0
36
1.07
89114280--89114416
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141
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2
0
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89114364--89114430
17
4.0
17
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4
0
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2.1
14
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0
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2.1
21
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24
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20
76
35
4
1
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1.28
89135258--89135312
25
2.2
24
83
3
65
32
3
3
60
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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