Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  301  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99168222--99168310
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51
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99244943--99245022
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108
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75
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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25
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1
123
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3
20
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.67
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2.0
40
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1.75
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2.0
22
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9
52
32
9
6
51
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99358498--99358535
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51
0
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99358502--99358539
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2.9
13
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51
0
34
2
63
1.09
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1.9
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11
0
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52
17
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17
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1.67
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9.0
46
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0
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13
23
22
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99364923--99364955
17
2.0
17
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59
48
0
15
36
1.45
99365039--99365078
21
2.0
20
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5
53
12
20
27
40
1.88
99365111--99365252
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3.3
42
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2
203
25
30
21
22
1.98
99365283--99365318
17
2.0
20
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15
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5
5
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99365512--99365574
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99365520--99365602
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6
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71
2
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22
1.14
99365513--99365574
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25
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3
1
22
1.08
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24
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0
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1.84
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2.0
17
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1.26
99372528--99372566
17
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43
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0
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1.24
99372532--99372571
17
2.3
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47
5
0
47
1.24
99372651--99372702
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99372527--99372818
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2.4
120
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2
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1.40
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3.1
59
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1.42
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45
0
2
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1.13
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15
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15
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0
0
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0
0
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203
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2
3
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0
28
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20
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0
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30
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0
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21
3.0
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13
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21
3
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2.0
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0
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2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99387782--99387910
51
2.5
51
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2
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16
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20
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11
15
36
1.85
99390334--99390629
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16.1
18
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1.30
99395299--99395384
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3.9
21
73
17
68
56
9
0
33
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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