Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  192  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62869429--62869731
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4.6
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24
1.98
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3.2
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28
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62879752--62879782
12
2.6
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0
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2
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62879828--62879888
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62880794--62880875
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33
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2.2
27
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2
77
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1.91
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13.7
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19
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31
1.81
62910811--62911179
54
6.8
54
82
4
415
40
19
8
31
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62910811--62911179
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81
82
4
431
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19
8
31
1.81
62911160--62911238
27
2.9
27
82
0
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8
29
1.81
62910831--62911225
81
4.9
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3
242
41
18
8
31
1.81
62914046--62914111
28
2.4
28
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0
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24
18
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24
1.97
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14.4
27
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1
451
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20
8
31
1.83
62914798--62914851
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2.0
26
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3
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20
11
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1.86
62917763--62917819
21
2.7
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12
66
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1.94
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21
2.2
21
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18
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4
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4
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15
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1
21
3
74
1.03
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20
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2
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2.0
35
94
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13
62
43
0
3
52
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1424
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21
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17
5.4
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19
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8
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10
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10
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0
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0
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0
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27
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23
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1.94
63012594--63012708
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2.1
54
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169
36
23
23
16
1.94
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0
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48
1.66
63014326--63014435
26
4.2
26
95
2
177
36
24
4
34
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63015703--63015731
14
2.1
14
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51
58
0
0
41
0.98
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3.4
13
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12
54
54
0
0
45
0.99
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2.4
19
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55
0
0
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0.99
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2.0
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1.60
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1.54
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100
0
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0
2
28
1.02
63021742--63021903
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16.5
10
73
16
108
64
1
2
31
1.17
63021743--63021797
11
5.4
11
75
12
55
70
0
1
27
0.97
63021782--63021854
29
2.6
29
78
8
80
60
2
2
34
1.25
63021744--63021861
19
6.3
17
72
18
60
64
1
2
31
1.17
63021918--63021963
20
2.3
20
85
7
58
54
4
0
41
1.20
63022418--63022461
19
2.3
19
84
0
52
25
2
2
70
1.10
63022481--63022590
9
11.8
9
72
23
77
37
0
2
60
1.11
63022499--63022607
10
11.9
9
76
17
100
34
0
1
62
1.12
63022492--63022607
37
3.1
36
77
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35
0
1
62
1.12
63022504--63022607
29
3.8
25
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33
0
0
64
1.07
63022507--63022607
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27
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34
0
0
63
1.08
63022513--63022582
19
3.7
19
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22
76
34
0
1
64
1.03
63031608--63031641
17
2.1
16
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5
50
52
0
0
47
1.00
63032261--63032298
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2.7
14
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8
51
42
2
13
42
1.57
63038899--63038989
17
5.4
17
71
19
64
27
14
17
40
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63038864--63038952
34
2.6
34
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0
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30
15
16
37
1.91
63045384--63045438
10
5.3
10
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56
1
0
41
1.10
63045384--63045447
20
3.0
20
77
8
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56
1
0
42
1.09
63045402--63045466
29
2.2
29
84
13
80
47
3
1
47
1.27
63046611--63046658
20
2.3
21
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50
10
10
29
1.70
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2.0
66
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0
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16
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7
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0
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0
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1
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24
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18
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14
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1.9
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28
18
3
49
1.64
63073443--63073511
30
2.3
31
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28
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1.70
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13
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0
2
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1.10
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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1
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2.0
19
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0
0
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2.0
35
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0
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1
0
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20
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31
11
14
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1.81
63107248--63107313
20
3.2
20
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12
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54
9
4
31
1.52
63107453--63107495
22
2.0
22
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39
13
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39
1.72
63131174--63131398
49
4.5
49
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2
270
26
17
27
29
1.97
63131174--63131355
99
1.8
101
87
2
278
26
16
27
29
1.97
63141796--63141878
40
2.1
40
97
0
157
32
14
26
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63148871--63148936
23
2.9
22
81
4
78
30
10
16
42
1.82
63150521--63150554
12
2.8
13
91
8
54
23
0
8
67
1.18
63154374--63154414
18
2.3
18
80
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24
0
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2.4
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100
0
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0
54
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25
2.0
25
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27
14
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1.60
63172911--63173349
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46
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538
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84
4.6
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597
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24
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1.95
63172956--63173398
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24
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2.4
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100
0
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23
25
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1.94
63173281--63173387
38
2.8
38
92
0
187
22
26
16
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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