Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  105  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.51
Indices
Period
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Number
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Percent
Indels
Score
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22
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1.99
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Period
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Indels
Score
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
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14
1.93
33865527--33865581
27
1.9
30
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10
71
3
20
5
70
1.22
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4
8.0
4
100
0
64
25
0
0
75
0.81
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21
3.9
21
77
3
67
37
26
20
15
1.93
33871868--33871942
21
3.5
22
78
9
82
38
26
20
14
1.91
33873438--33873492
27
1.9
30
82
10
71
3
20
5
70
1.22
33891541--33891707
46
3.5
46
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43
16
9
29
1.80
33891566--33891759
54
3.7
54
75
12
215
43
17
8
30
1.78
33891538--33891749
100
2.1
100
93
0
361
44
15
8
30
1.77
33892704--33892782
32
2.5
32
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4
124
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20
1
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1.55
33892764--33892810
21
2.1
21
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7
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19
0
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33905298--33905336
19
2.1
19
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0
51
48
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20
7
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40
5.7
40
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4
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26
27
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1.99
33915207--33915432
40
5.7
40
91
4
323
26
27
21
24
1.99
33921646--33921673
14
2.0
14
100
0
56
21
14
14
50
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33925756--33925803
20
2.5
20
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3
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64
2
6
27
1.28
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15
2.1
15
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0
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0
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0
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0
0
48
1.00
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2.1
18
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0
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57
7
7
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1.54
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25
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0
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1.97
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25
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81
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1.99
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2.3
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1.96
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25
2.00
33937782--33938004
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2.00
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2.5
26
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0
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0
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52
0
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1.13
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2.1
37
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0
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2
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4
100
0
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0
25
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1.50
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1.9
14
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0
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18
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0
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42
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34
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33970397--33970454
22
2.6
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41
17
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1.72
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19
87
10
195
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14
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36
1.82
33970433--33970555
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2.3
54
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0
237
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14
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1.82
33970433--33970552
35
3.3
36
87
6
181
37
15
11
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33973694--33973773
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2.0
40
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0
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2
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40
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2.9
20
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1
1
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1.13
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2
0
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2
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33978150--33978193
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23
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65
2
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1.80
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2.7
40
82
2
124
28
25
24
21
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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