Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  46  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13203612--13203742
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0
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2.3
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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6
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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16
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15
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2.0
21
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0
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46
4
4
44
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13379645--13379705
28
2.2
28
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2
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6
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34
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17.3
3
87
0
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3
1
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32
5
0
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2
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4
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50
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3
3
72
1.11
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22
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20
5
4
69
1.25
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43
2.2
44
90
3
147
21
4
3
71
1.18
13397270--13397324
27
2.0
27
100
0
110
43
7
23
25
1.79
13397955--13397988
16
2.1
16
89
10
52
76
2
11
8
1.12
13400291--13400362
35
2.1
35
100
0
144
43
11
16
29
1.82
13405171--13405280
50
2.2
50
85
6
143
28
13
26
31
1.94
13412948--13412977
5
6.2
5
92
7
53
0
60
40
0
0.97
13414289--13414362
32
2.3
32
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0
94
22
17
28
31
1.97
13414559--13414612
23
2.4
22
72
9
54
31
5
1
61
1.30
13415187--13415238
26
2.0
26
100
0
104
38
15
15
30
1.88
13417471--13417521
21
2.4
21
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12
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64
1
0
33
1.05
13420059--13420119
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0
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27
18
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1.87
13420168--13420224
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26
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6
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17
22
19
40
1.91
13421183--13421280
19
5.2
19
91
7
155
38
10
15
35
1.81
13421173--13421280
36
2.9
35
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20
103
38
10
14
36
1.80
13423902--13423934
2
17.0
2
87
6
50
48
0
51
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13424078--13424120
2
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2
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4
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55
0
44
0
0.99
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186
2.0
187
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1
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39
14
24
22
1.91
13426645--13426686
7
5.9
7
81
15
50
88
0
9
2
0.61
13426642--13426687
21
2.2
21
92
3
76
89
0
8
2
0.57
13426642--13426687
22
2.1
21
88
11
67
89
0
8
2
0.57
13426642--13426687
16
2.8
16
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18
51
89
0
8
2
0.57
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43
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16
375
28
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26
29
1.96
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2.7
130
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4
517
28
15
26
29
1.96
13427774--13428384
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3.5
176
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0
947
29
15
26
29
1.96
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132
6.0
132
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29
15
25
29
1.96
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44
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13
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29
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24
27
1.97
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2.1
134
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0
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27
1.97
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2.0
47
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2
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32
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23
23
1.97
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45
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25
1.94
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19
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36
1.80
13429330--13429446
36
3.1
38
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7
184
38
9
15
36
1.80
13429336--13429446
55
2.0
56
92
3
188
38
9
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36
1.79
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17
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13
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33
0
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1.51
13439154--13439192
18
2.2
17
86
13
53
33
0
20
46
1.51
13442148--13442215
32
2.1
32
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5
84
45
10
4
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1.58
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2.5
28
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2
1
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1.21
13451085--13451144
13
4.5
13
72
2
57
36
1
21
40
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13451048--13451127
26
3.0
26
77
14
74
41
2
18
37
1.64
13451962--13451998
9
4.1
9
92
0
65
45
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29
1.77
13452210--13452268
30
2.0
30
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93
18
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0
44
1.50
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2.3
24
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50
0
0
50
1.00
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1.9
22
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0
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290
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0
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1.09
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7
3.6
7
100
0
50
16
0
0
84
0.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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