Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  317  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103627690--103627779
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36
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0
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2.0
27
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17
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46
5
0
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1.26
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18
2.5
17
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10
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2
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1.27
103634632--103634673
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3.3
13
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40
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42
1.58
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0
0
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1.9
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12
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2
0
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0
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20
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1.9
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6
83
68
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1.31
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1.9
19
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2.0
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3
22
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3.3
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5
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35
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1.9
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0
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1.06
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25
2.4
25
88
8
86
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20
5
3
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103657997--103658056
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2.4
25
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1.19
103658002--103658066
25
2.7
24
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67
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1.24
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302
27
27
22
22
1.99
103672329--103672480
71
2.2
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2
196
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1.92
103672480--103672645
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2.3
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253
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3.5
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2.5
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2.0
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2.0
121
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19
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103673580--103674088
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404
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103673939--103673974
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30
13
5
50
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385
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2.1
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2.0
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4
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3
0
56
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2
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44
1.49
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1.8
170
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4
424
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11
13
46
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.91
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16
3.1
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27
2
2
68
1.11
103695555--103695625
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6.5
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75
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29
2
2
64
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0
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0
0
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12
16
36
1.86
103703882--103704164
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0
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39
0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
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0
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0.95
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2.1
26
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60
7
11
20
1.55
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2.6
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76
5
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42
13
11
32
1.80
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0
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0
50
67
11
8
11
1.42
103744990--103745020
11
2.8
11
95
0
53
80
9
0
9
0.90
103745891--103745953
31
2.0
31
84
6
83
33
20
6
39
1.78
103749480--103749510
2
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2
100
0
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0
0
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1.00
103753457--103753481
2
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2
100
0
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0
48
0
1.00
103760099--103760185
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24
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13
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6
27
1.56
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495
2.3
495
99
0
2278
30
9
17
42
1.80
103765238--103765642
220
1.8
219
93
0
693
30
25
16
27
1.96
103765064--103765532
132
3.6
132
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1
735
29
26
15
28
1.96
103765064--103765646
88
6.6
88
80
4
532
29
25
16
28
1.97
103777842--103778110
139
2.0
135
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28
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33
1.93
103780382--103780495
42
2.7
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10
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22
1.68
103780408--103780495
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29
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16
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1.97
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132
3.8
132
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0
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29
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1.97
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2.0
45
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24
15
15
44
1.85
103802237--103802267
15
2.1
15
100
0
62
19
12
19
48
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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50
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0
15
2
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21
2.0
21
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0
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29
21
29
1.98
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3.6
11
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0
53
57
2
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27
1.48
103828328--103828492
82
2.0
82
90
4
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4
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0
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0
0
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0
2
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28
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2
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14
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2
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0
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0
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1.75
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16
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53
10
3
6
80
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103905894--103905941
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3.4
14
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0
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1.75
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2.2
18
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0
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1.66
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0
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0
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1.9
22
85
5
57
36
17
4
41
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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