Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  28  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
19
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48
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2
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0
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0
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2
7
43
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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45
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155
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45
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14
15
33
1.88
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1.8
125
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1
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10
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3
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1.31
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27
2.0
27
82
10
65
31
3
3
61
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7979946--7979994
25
2.0
25
84
15
66
28
24
24
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1.99
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1.98
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50
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1.98
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16
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60
6
0
33
1.23
8005150--8005550
88
4.6
88
74
12
298
38
19
14
26
1.91
8005394--8005769
73
4.8
77
77
11
374
34
22
15
27
1.95
8005543--8005716
86
2.0
86
84
2
224
39
21
13
25
1.90
8005627--8005781
72
2.2
71
90
1
238
38
23
15
23
1.93
8005388--8005769
158
2.5
154
86
3
525
35
21
15
27
1.94
8007368--8007502
70
1.9
70
80
3
155
19
13
21
45
1.84
8011290--8011333
17
2.8
16
82
6
54
38
4
6
50
1.50
8011345--8011385
20
2.1
19
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4
55
58
0
0
41
0.98
8011990--8012046
20
2.7
21
83
8
62
40
3
0
56
1.17
8016107--8016134
13
2.2
13
100
0
56
28
35
0
35
1.58
8023647--8023685
17
2.4
17
86
4
53
12
17
2
66
1.35
8023657--8023690
17
1.9
18
94
5
61
11
23
0
64
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8025100--8025130
15
2.1
15
100
0
62
32
9
19
38
1.84
8025870--8025935
27
2.4
27
89
0
105
16
30
36
16
1.91
8025964--8026026
19
3.6
18
79
18
71
0
34
6
58
1.23
8027011--8027081
27
2.6
28
88
2
108
56
2
12
28
1.50
8027011--8027091
27
3.0
27
78
5
65
58
2
13
25
1.48
8032816--8032857
21
2.0
22
85
4
59
54
16
2
26
1.54
8032911--8032973
25
2.5
26
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10
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58
6
11
23
1.55
8032914--8032973
26
2.4
25
82
2
66
58
6
11
23
1.57
8033251--8033295
19
2.3
19
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3
63
26
13
13
46
1.80
8033259--8033296
19
2.0
19
94
0
67
26
13
15
44
1.83
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16
2.2
16
90
0
54
63
19
0
16
1.30
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43
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4
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32
14
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1.94
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32
4.0
32
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3
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35
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10
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46
2.9
47
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7
139
22
22
13
41
1.88
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2.7
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0
147
23
21
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11
5.3
11
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5
0
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38
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24
18
1.93
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129
2.0
128
93
0
437
33
12
12
41
1.81
8068997--8069050
24
2.2
24
90
6
83
27
3
12
55
1.54
8069190--8069256
15
4.3
15
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7
62
31
14
2
50
1.58
8091890--8091962
32
2.3
32
90
0
110
21
23
38
16
1.93
8099138--8099234
28
3.4
28
77
8
97
35
8
19
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8099108--8099253
28
5.1
28
73
6
87
32
13
17
36
1.88
8104352--8104520
17
9.5
17
66
22
62
33
4
1
60
1.26
8104448--8104518
16
4.2
16
74
13
54
32
2
1
63
1.18
8104763--8104809
18
2.5
19
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3
51
31
2
0
65
1.04
8107872--8107904
16
2.0
17
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5
50
33
12
3
51
1.54
8122732--8123189
46
10.0
46
89
0
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40
14
24
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17
2.0
17
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2.0
21
90
0
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29
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7
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0
0
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0.70
8133221--8133251
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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