Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  27  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7650444--7650508
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0
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558
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2.3
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3.0
22
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0
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16
1.9
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0
36
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19
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0
30
0
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0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
3.4
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0
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2
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7669566--7669816
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2.4
105
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35
18
15
30
1.92
7669828--7669860
13
2.4
14
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5
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9
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62
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18
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20
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8
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15
3.2
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2.2
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11
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9
17
28
1.81
7680094--7680178
16
5.2
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10
75
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24.5
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11
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15.2
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13
98
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18
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8
55
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10
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7
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75
0
17
0
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15
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0
17
0
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0.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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3.9
13
79
20
59
0
37
0
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10
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0
65
0
36
0
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0.95
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30
3.9
29
77
11
94
44
3
21
30
1.69
7681571--7681672
30
3.4
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83
2
125
44
3
21
30
1.70
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0
2
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2.1
18
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0
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18
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2
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4
4
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3
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1.28
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14
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0
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58
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35
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148
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19
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130
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16
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2
5
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21
2.8
20
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10
60
56
7
1
34
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7712400--7712476
3
26.0
3
69
12
52
58
3
5
32
1.38
7712429--7712479
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4.2
12
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7
59
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3
1
31
1.24
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0
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0
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21
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8
61
27
11
0
61
1.30
7744572--7744617
19
2.4
19
85
7
58
19
23
13
43
1.86
7748705--7748744
21
1.9
21
94
0
71
42
10
12
35
1.76
7749226--7749546
44
7.3
43
66
15
163
32
21
24
21
1.98
7749219--7749717
88
5.6
88
85
3
599
32
21
23
22
1.98
7749193--7749717
178
3.0
179
86
1
691
33
21
23
22
1.98
7749261--7749683
44
9.5
44
65
15
149
33
21
23
22
1.98
7751892--7752085
105
1.9
101
82
6
246
27
24
14
32
1.95
7753031--7753103
36
2.0
36
97
0
137
41
13
15
30
1.85
7758807--7758838
3
10.7
3
93
0
55
3
31
0
65
1.08
7762607--7762669
27
2.3
27
83
0
81
25
38
20
15
1.92
7767587--7767612
12
2.2
12
100
0
52
46
0
7
46
1.31
7776017--7776061
22
2.0
22
86
8
63
51
4
0
44
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7776163--7776220
21
2.7
22
78
19
61
32
3
0
63
1.11
7777251--7777343
48
1.9
48
91
0
150
20
20
27
31
1.97
7779274--7779307
11
2.9
12
82
8
52
23
5
0
70
1.09
7785675--7785747
22
3.3
22
78
3
76
60
13
9
16
1.59
7789204--7789238
3
11.7
3
100
0
70
34
0
0
65
0.93
7792790--7793143
176
2.0
177
92
0
593
43
18
14
22
1.87
7796917--7796969
27
2.0
27
96
0
97
28
30
24
16
1.97
7796884--7797147
102
2.6
104
90
3
408
29
29
20
19
1.97
7797474--7797538
30
2.2
29
81
8
76
30
27
6
35
1.81
7797481--7797538
30
1.9
30
85
0
80
31
24
6
37
1.82
7808434--7808486
18
2.9
18
100
0
106
33
20
22
22
1.97
7812787--7812822
17
2.1
18
89
5
56
55
0
2
41
1.14
7812795--7812836
21
1.9
23
90
9
70
54
0
0
45
0.99
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42
2.0
42
86
0
116
25
16
10
47
1.79
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12
3.1
12
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4
56
75
0
0
25
0.81
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19
2.3
18
84
15
52
74
0
0
25
0.82
7819183--7819241
11
5.4
11
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0
73
27
10
3
59
1.46
7819422--7819454
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
7819608--7819636
13
2.2
13
100
0
58
13
13
24
48
1.79
7822346--7822399
23
2.5
23
82
8
60
61
7
0
31
1.24
7822480--7822533
24
2.2
26
83
9
69
70
0
5
24
1.08
7822598--7822723
18
7.4
17
69
18
68
66
0
6
26
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7822608--7822653
15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
7822623--7822713
14
6.4
13
73
23
60
64
0
7
27
1.20
7822618--7822739
29
4.2
30
69
16
76
65
0
6
27
1.22
7822608--7822730
14
8.5
15
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20
50
67
0
5
26
1.13
7823703--7824325
178
3.5
178
88
1
885
29
22
18
30
1.97
7824224--7824413
88
2.2
88
89
0
290
30
20
20
30
1.97
7824312--7824818
177
2.9
177
84
1
649
28
21
18
31
1.97
7823909--7824761
443
1.9
444
85
1
1122
28
22
18
30
1.97
7830774--7831013
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1.9
127
86
0
347
39
20
16
23
1.92
7831141--7831194
23
2.5
23
82
8
60
61
7
0
31
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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