Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  30  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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47
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4
207
23
26
18
30
1.98
8659738--8659860
56
2.2
56
82
4
149
30
17
21
30
1.96
8659827--8659954
64
2.0
64
90
0
202
25
15
28
31
1.96
8662144--8662336
39
5.0
40
86
4
159
27
29
22
20
1.98
8662173--8662336
78
2.1
78
84
5
208
26
29
22
21
1.99
8662211--8662336
39
3.2
39
95
0
216
26
30
21
21
1.98
8665090--8665134
22
2.0
22
91
0
72
35
11
13
40
1.80
8667907--8668055
51
2.9
50
83
5
192
32
25
10
30
1.90
8668187--8668256
33
2.1
33
89
0
104
24
37
2
35
1.70
8668196--8668270
33
2.3
33
81
4
89
25
37
2
34
1.70
8669299--8669334
16
2.2
16
90
0
54
30
2
27
38
1.71
8670309--8670340
15
2.1
15
94
0
55
15
6
9
68
1.36
8672954--8673040
43
2.0
43
100
0
174
32
20
13
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8673491--8673534
21
2.1
21
100
0
88
47
0
29
22
1.51
8678823--8678877
26
2.1
26
96
0
101
25
9
3
61
1.42
8681196--8681510
162
2.0
162
80
3
368
40
7
11
41
1.68
8687163--8687202
16
2.4
17
87
4
55
75
2
2
20
1.04
8687696--8687723
5
5.6
5
100
0
56
0
17
0
82
0.68
8692112--8692234
51
2.4
49
75
7
120
36
8
4
50
1.53
8696481--8696523
19
2.3
18
80
4
50
58
0
6
34
1.25
8700450--8700589
39
3.6
39
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0
199
15
25
22
36
1.94
8701475--8701507
16
2.1
16
94
0
57
3
15
6
75
1.11
8706088--8706113
2
13.0
2
100
0
52
50
50
0
0
1.00
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25
2.0
25
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4
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63
8
0
28
1.23
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25
1.9
23
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65
63
8
0
28
1.24
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12
2.7
13
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52
0
0
47
1.00
8708027--8708066
21
1.9
21
84
0
53
47
5
15
32
1.66
8709784--8709822
4
9.8
4
100
0
78
23
0
25
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1.49
8711784--8711877
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3.6
26
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2
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26
5
8
59
1.48
8713800--8713824
13
1.9
13
100
0
50
40
0
8
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1.31
8715327--8715387
27
2.3
27
80
5
70
42
0
4
52
1.23
8715354--8715399
18
2.4
18
86
13
58
45
0
6
47
1.28
8720635--8720678
21
2.1
21
86
0
61
31
27
11
29
1.91
8728278--8728308
15
2.1
15
100
0
62
25
12
12
48
1.77
8729158--8729266
53
2.1
53
94
3
193
31
22
21
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8730631--8730664
11
3.1
11
88
12
52
70
17
8
2
1.25
8734340--8734365
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
8734691--8734920
35
6.6
35
81
2
266
33
13
22
30
1.93
8737415--8737499
21
3.9
23
81
9
88
14
22
25
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1.92
8740774--8740807
11
3.1
11
88
12
52
70
17
8
2
1.25
8747598--8747777
31
5.8
31
90
3
274
28
19
26
26
1.99
8747807--8747946
42
3.2
43
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8
151
31
15
27
26
1.95
8747849--8747946
42
2.3
42
91
3
153
30
15
28
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1.96
8759701--8759747
21
2.2
22
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23
19
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21
1.95
8764240--8764305
31
2.3
29
84
10
82
39
16
10
33
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333