Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  33  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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28
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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1.9
93
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2.0
52
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204
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186
2.7
185
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1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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1
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50
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9340098--9340276
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3.1
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0
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0
27
1.57
9343811--9343856
23
2.0
23
95
0
83
28
10
4
56
1.53
9361757--9361795
20
2.0
20
89
0
60
12
28
15
43
1.83
9372326--9372351
11
2.4
11
100
0
52
11
7
0
80
0.89
9372392--9372451
26
2.3
26
82
5
77
21
6
3
68
1.28
9373854--9373888
17
2.1
17
100
0
70
22
28
5
42
1.76
9377006--9377252
84
2.9
84
81
1
226
27
25
22
25
2.00
9377090--9377252
42
3.9
42
86
3
247
28
24
22
24
2.00
9378164--9378225
17
3.8
16
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10
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54
1
1
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1.19
9379806--9379836
16
1.9
16
93
0
53
70
9
9
9
1.33
9384465--9384532
34
2.0
34
97
0
127
29
22
19
29
1.98
9396006--9396034
5
6.0
5
96
4
51
41
0
0
58
0.98
9396083--9396117
17
2.0
18
88
5
54
48
2
11
37
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9396094--9396138
23
2.0
23
86
0
63
42
4
8
44
1.56
9397304--9397353
5
10.0
5
95
0
91
60
2
0
38
1.09
9399772--9399885
43
2.7
43
86
5
142
26
17
24
31
1.97
9402385--9402561
50
3.5
50
94
2
293
36
16
22
25
1.94
9402537--9402716
31
5.8
31
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0
279
28
17
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26
1.98
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3.0
43
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5
120
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16
26
30
1.96
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25
2.0
25
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0
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1.78
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20
20
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1.95
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23
2.0
23
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15
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23
43
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24
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18
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1.92
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24
2.3
23
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16
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24
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3.0
50
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27
29
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1.97
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50
2.5
50
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1
198
28
28
16
25
1.97
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12
2.2
12
100
0
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22
29
25
22
1.99
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30
9
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1.88
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40
2.1
40
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35
29
14
21
1.92
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22
2.1
23
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47
0
2
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1.12
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15
3.2
15
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21
50
50
0
0
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1.00
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2.1
27
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0
94
30
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16
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1.92
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18
1.9
18
100
0
70
45
28
2
22
1.67
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23
2.0
23
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0
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24
2
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1.64
9432898--9432964
16
3.9
16
75
9
53
67
0
2
29
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9432972--9433029
28
2.0
29
86
6
82
60
1
5
32
1.29
9432985--9433038
28
1.9
28
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7
74
62
1
7
27
1.32
9433238--9433320
9
8.7
9
74
10
58
31
6
0
62
1.19
9433238--9433320
19
4.3
19
79
10
80
31
6
0
62
1.19
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2.3
85
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230
34
15
9
40
1.81
9433933--9434090
87
1.8
84
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6
210
34
16
10
38
1.83
9434330--9434403
19
3.8
19
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1
0
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1.05
9434330--9434403
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10
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11
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1
0
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1.05
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33
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2
149
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11
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13
1.77
9439019--9439145
66
1.9
66
85
3
175
28
10
47
14
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333