Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  293  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.97
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96898710--96898748
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55
1.10
96905185--96905223
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
96905464--96905598
39
3.4
39
74
6
112
23
20
28
28
1.99
96905721--96905761
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
96920586--96920623
13
3.0
13
84
7
51
31
0
0
68
0.90
96920870--96920909
21
1.9
21
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0
62
62
7
12
17
1.52
96925118--96925198
28
2.9
28
85
1
101
48
19
11
20
1.79
96925127--96925206
27
2.9
27
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5
81
46
20
11
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1.82
96925682--96925716
2
17.5
2
93
0
61
54
0
0
45
0.99
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15
2.6
16
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0
0
48
1.00
96933670--96933699
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14
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0
13
0
86
0.57
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10
3.3
10
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4
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62
0
6
31
1.20
96937918--96937947
15
2.0
15
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0
51
40
10
0
50
1.36
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41
2.1
41
100
0
170
43
7
27
22
1.79
96939567--96939628
5
12.4
5
74
19
58
79
0
3
17
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96939568--96939617
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2.9
17
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8
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78
0
4
18
0.91
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6
6.7
6
87
6
53
81
0
2
15
0.80
96939567--96939630
22
2.9
21
84
11
76
78
0
3
18
0.89
96939570--96939628
16
3.5
17
82
13
70
79
0
3
16
0.86
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10
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10
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4
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62
0
6
31
1.20
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2.3
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11
1
36
1.47
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2.3
30
100
0
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1.94
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2.1
19
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51
9
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1.62
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2.0
37
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0
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2.0
24
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4
0
32
1.13
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2.3
26
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3
0
26
1.04
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2.2
21
84
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4
0
22
1.01
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2.0
21
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53
0
19
26
1.45
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40
4.8
40
90
3
221
27
27
21
23
1.99
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2.7
80
80
7
244
28
27
21
23
1.99
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29
1.9
29
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85
32
23
20
23
1.98
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31
2.7
30
88
3
123
30
25
14
30
1.95
97012425--97012494
25
2.8
26
84
6
99
25
21
24
28
1.99
97013295--97013372
27
2.9
27
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11
79
21
20
21
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1.96
97013413--97013492
27
2.9
27
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10
83
35
8
15
41
1.78
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4.6
27
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7
135
28
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20
42
1.80
97013477--97013629
81
1.9
81
83
2
200
28
10
19
41
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97013619--97013695
27
2.9
27
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5
77
37
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23
25
1.91
97044115--97044151
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2.2
17
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13
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43
0
0
56
0.99
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18
2.3
17
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2
7
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1.28
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23
2.2
23
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1
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1.32
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2
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1.38
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124
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1
2
63
1.18
97066367--97066525
32
5.4
31
73
23
112
32
2
3
61
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333