Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  84  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25988752--25988814
23
2.8
24
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9
78
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19
36
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25988807--25988861
22
2.4
23
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1.96
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131
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2.0
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0
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19
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4.1
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23
19
21
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2.2
52
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0
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24
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1.93
26000482--26000597
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4.4
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154
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13
24
26
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2
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1.8
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0
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20
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20
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4.6
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25
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4.6
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257
23
21
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2.6
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25
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28
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35
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16
20
25
1.93
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70
30
11
21
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3.8
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90
0
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3
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2.3
17
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0
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20
7
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1.58
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16
2.5
16
100
0
80
62
0
0
37
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26070861--26070890
6
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4
51
13
0
0
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139
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2
461
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19
26
1.97
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46
2.9
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33
26
20
20
1.97
26076672--26076849
47
3.8
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6
193
33
26
19
21
1.97
26092827--26092865
19
2.1
19
100
0
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20
10
17
1.74
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20
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1.19
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10
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10
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57
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1.07
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21
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67
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1.10
26097934--26097979
22
2.2
20
84
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56
63
2
0
34
1.07
26101167--26101665
161
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158
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592
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11
12
29
1.76
26101135--26101618
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81
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435
46
10
11
30
1.75
26101172--26101699
238
2.2
232
78
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12
11
30
1.76
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26
4.2
26
92
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1.81
26109700--26109807
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4.2
26
93
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32
7
24
36
1.83
26111969--26112191
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5.7
40
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8
239
26
22
26
25
2.00
26111975--26112191
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80
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26
21
26
25
2.00
26112021--26112224
79
2.6
79
82
8
195
26
21
26
25
1.99
26117436--26117480
20
2.2
20
80
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31
2
6
60
1.35
26117437--26117490
21
2.6
21
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3
5
55
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70
2.1
70
97
0
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8
18
34
1.81
26118891--26119005
42
2.7
43
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2
124
29
26
17
26
1.97
26118912--26119007
42
2.3
42
88
1
147
29
30
17
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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29
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1.61
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2.1
19
86
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55
48
34
0
17
1.47
26123229--26123260
14
2.3
14
94
0
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56
28
0
15
1.40
26123982--26124119
41
3.4
41
93
0
222
28
29
16
25
1.97
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41
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1
142
21
19
23
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1.95
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20
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29
1
0
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1.00
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13
84
0
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5
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1.55
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29
24
17
27
1.97
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42
2.0
42
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5
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8
10
47
1.69
26132889--26132953
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26
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76
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17
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1.10
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23
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18
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15
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1.47
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2.00
26149679--26149863
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23
2.00
26155452--26155661
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5.3
39
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2
316
25
22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26155403--26155661
39
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25
22
27
24
2.00
26163416--26163677
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337
25
22
27
24
2.00
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26
27
21
24
1.99
26168980--26169164
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2.3
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207
26
27
21
24
1.99
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3.0
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192
25
26
15
32
1.96
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2.7
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339
25
26
26
21
2.00
26179692--26179955
119
2.2
121
86
1
352
24
25
27
22
2.00
26179694--26179955
40
6.6
40
79
4
278
24
25
27
22
2.00
26186773--26186807
17
2.1
17
94
0
61
54
0
8
37
1.31
26189316--26189805
27
18.2
27
84
3
549
27
21
9
41
1.84
26189318--26189816
108
4.6
107
86
3
628
27
20
9
41
1.84
26189810--26190005
27
7.3
27
84
0
248
36
19
18
25
1.94
26189810--26190006
54
3.6
54
86
2
279
37
19
18
25
1.94
26190204--26190286
27
3.1
26
87
5
112
19
21
21
37
1.94
26190374--26190432
22
2.7
22
81
0
64
20
25
22
32
1.98
26190597--26190670
27
2.8
27
85
6
89
17
24
21
36
1.95
26190788--26190986
6
32.8
6
75
15
178
20
18
14
46
1.83
26190822--26190986
30
5.5
30
91
1
267
20
18
14
46
1.84
26190788--26190986
61
3.2
66
88
7
267
20
18
14
46
1.83
26202146--26202174
13
2.2
13
100
0
58
20
34
31
13
1.92
26202613--26202649
17
2.2
17
100
0
74
21
5
13
59
1.54
26211338--26211589
127
2.0
127
99
0
495
23
17
26
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26215043--26215071
11
2.5
12
88
11
51
55
6
0
37
1.27
26215237--26215284
23
2.2
21
82
10
60
35
0
0
64
0.94
26215211--26215288
29
2.6
30
84
8
97
39
0
2
57
1.12
26215243--26215285
23
1.9
23
90
4
70
37
0
0
62
0.95
26216801--26216891
47
1.9
47
88
0
137
29
13
19
37
1.90
26217433--26217463
15
2.1
15
100
0
62
12
6
41
38
1.69
26227674--26227722
21
2.5
19
87
9
71
61
2
0
36
1.08
26230867--26231044
27
6.6
27
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3
205
29
28
15
26
1.96
26230888--26231043
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
26231594--26231618
13
1.9
13
100
0
50
32
16
20
32
1.94
26235490--26235587
19
5.2
19
88
7
146
34
16
10
38
1.82
26235490--26235587
36
2.6
37
87
9
135
34
16
10
38
1.82
26235531--26235568
17
2.5
15
87
12
51
34
15
10
39
1.82
26235838--26236264
83
5.1
84
92
1
716
25
22
22
29
1.99
26235833--26236261
167
2.6
168
92
1
711
26
21
21
29
1.99
26237212--26237264
6
8.7
6
86
13
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0
16
0
83
0.66
26237212--26237276
21
3.2
21
82
8
73
0
16
0
83
0.66
26237212--26237264
13
4.3
12
84
15
65
0
16
0
83
0.66
26237212--26237276
20
3.4
18
80
19
71
0
16
0
83
0.66
26237214--26237272
27
2.2
27
87
6
84
0
18
0
81
0.69
26237212--26237276
13
5.2
13
80
10
57
0
16
0
83
0.66
26237215--26237273
6
8.9
7
77
19
56
0
18
0
81
0.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26243290--26243323
15
2.3
15
90
5
52
67
5
0
26
1.13
26248966--26249033
35
1.9
36
84
3
93
25
29
13
32
1.93
26258774--26258808
17
2.1
17
88
0
52
14
14
22
48
1.79
26264963--26264992
15
2.0
15
93
0
51
40
23
13
23
1.90
26267198--26267451
55
4.8
53
78
9
227
36
17
24
22
1.94
26267205--26267405
108
1.8
109
84
6
273
34
17
24
22
1.96
26274690--26274923
55
4.4
53
77
10
221
35
17
24
21
1.95
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55
3.7
53
80
5
224
34
17
24
22
1.96
26274697--26274897
108
1.8
110
88
4
309
34
17
24
22
1.96
26289776--26289885
55
2.0
55
96
0
202
24
10
12
52
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333