Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  302  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.17
Indices
Period
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Indels
Score
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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26
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29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.21
99632059--99632101
22
2.0
22
95
0
77
30
39
20
9
1.84
99633303--99633352
21
2.4
21
86
0
73
22
36
30
12
1.90
99637967--99638026
28
2.1
30
81
6
70
5
18
6
70
1.29
99638330--99638368
12
3.1
12
82
13
51
53
0
0
46
1.00
99639576--99639650
21
3.6
21
79
0
78
22
25
32
20
1.98
99640232--99640261
15
1.9
16
93
6
53
80
3
0
16
0.85
99654763--99654787
13
1.9
13
100
0
50
0
0
8
92
0.40
99657832--99657862
14
2.2
14
100
0
62
45
6
0
48
1.28
99659687--99659738
16
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16
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15
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55
0
11
32
1.36
99659910--99660030
53
2.3
53
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15
19
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42
1.88
99660229--99660343
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4
97
34
8
16
40
1.79
99662558--99662665
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
99665416--99665459
18
2.4
18
85
7
54
43
2
4
50
1.35
99668393--99668422
6
5.0
6
100
0
60
50
0
0
50
1.00
99669497--99669567
24
2.9
25
68
6
65
38
7
2
52
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99669894--99669962
21
3.3
21
70
11
61
23
21
7
47
1.75
99671014--99671051
18
2.1
19
85
5
51
60
18
5
15
1.53
99671135--99671167
14
2.3
15
94
5
59
57
6
9
27
1.53
99672006--99672036
16
1.9
16
93
0
53
41
16
16
25
1.88
99672998--99673090
43
2.2
43
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0
177
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8
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36
1.76
99677387--99677418
16
2.0
16
93
0
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40
6
6
46
1.54
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17
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18
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5
52
52
5
11
29
1.61
99698967--99699085
5
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5
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77
75
0
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20
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3.1
35
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0
3
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4.7
24
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22
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75
0
4
20
0.97
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6
10.7
6
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19
57
77
0
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19
0.90
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27
3.9
26
77
20
89
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0
3
20
0.94
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39
3.6
39
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0
208
39
23
23
13
1.90
99733401--99733434
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2.1
17
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5
52
52
0
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1.33
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18
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52
58
0
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1.38
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18
2.1
18
100
0
76
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10
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39
1.61
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46
7.0
46
92
0
489
39
14
23
22
1.91
99754629--99754691
27
2.4
27
81
2
74
30
9
1
58
1.39
99754629--99754713
27
3.3
26
74
21
72
31
9
1
57
1.38
99754646--99754713
24
2.7
27
78
17
74
32
8
1
57
1.39
99755196--99755225
14
2.1
14
100
0
60
33
6
0
60
1.23
99755206--99755290
23
3.5
24
73
23
79
35
8
4
51
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99755196--99755352
64
2.5
58
75
16
136
34
6
5
54
1.48
99755283--99755340
23
2.6
23
83
8
66
34
3
5
56
1.38
99755388--99755448
24
2.7
22
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7
59
37
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4
50
1.50
99755512--99755573
29
2.1
29
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81
27
4
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62
1.36
99755543--99755606
25
2.5
25
82
2
83
32
7
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53
1.55
99756644--99756684
20
2.1
19
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19
7
0
73
1.07
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48
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150
29
25
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0
0
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0.66
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3
1
80
0.90
99765107--99765158
3
17.3
3
100
0
104
0
32
0
67
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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