Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  216  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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11
5
41
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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12
28
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71315314--71315396
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25
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50
7.7
50
77
4
375
29
22
17
29
1.97
71349019--71349460
151
2.9
151
86
4
579
30
23
17
28
1.97
71349016--71349460
50
8.8
50
77
5
351
30
23
17
28
1.97
71351320--71351378
10
5.9
10
86
7
75
66
1
10
22
1.31
71351984--71352175
99
1.9
101
85
4
264
32
24
14
28
1.94
71352876--71352900
9
2.8
9
100
0
50
12
0
28
60
1.32
71354664--71354883
40
5.6
40
83
4
259
25
26
23
24
2.00
71362812--71362901
40
2.2
40
94
2
153
21
24
26
27
1.99
71378421--71378631
40
5.3
40
84
3
248
26
27
21
24
1.99
71381774--71381886
27
4.2
26
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8
109
18
22
21
38
1.94
71387354--71387491
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29
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1.95
71395999--71396026
9
3.1
9
100
0
56
10
0
21
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1.20
71408072--71408143
35
2.1
35
100
0
144
29
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37
1.90
71410034--71410167
55
2.4
55
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0
223
26
13
24
35
1.92
71414906--71415013
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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5
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0
1
24
0.89
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7
9.4
7
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16
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0
1
25
0.92
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22
3.3
22
79
11
87
73
0
1
24
0.90
71415430--71415504
27
2.5
27
83
14
78
74
0
1
24
0.89
71415431--71415503
4
16.8
4
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51
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0
1
24
0.90
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4.1
41
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10
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20
1.95
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189
2.0
189
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0
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1.91
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0
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1.34
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4.9
49
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1.98
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2.3
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2
320
29
28
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1.98
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1.9
30
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1.82
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15
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49
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2
264
28
26
18
26
1.98
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100
2.0
100
93
0
344
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26
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25
1.98
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2.0
30
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33
26
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36
1.73
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1.30
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31
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0
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9
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10
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4
0
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1.13
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31
2.1
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0
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26
23
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35
1.93
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24
5.1
24
88
4
192
28
20
21
28
1.98
71453838--71453957
23
5.1
23
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186
29
20
21
28
1.98
71453838--71453957
47
2.6
47
94
0
204
29
20
21
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71454016--71454072
9
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9
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21
8
35
1.84
71454004--71454074
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
71454009--71454063
11
5.4
11
70
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55
30
20
12
36
1.90
71454111--71454158
25
2.0
24
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4
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25
16
25
33
1.96
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10
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28
1.86
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3.0
84
84
12
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33
9
29
28
1.88
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179
1.9
177
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1
591
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215
27
21
21
29
1.99
71465609--71465659
20
2.5
20
93
0
84
33
21
11
33
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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