Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  274  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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G
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
90898762--90898826
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3.3
11
88
0
54
19
0
11
69
1.18
90927944--90928079
51
2.7
51
77
0
155
39
6
12
41
1.69
90930798--90930933
51
2.7
51
77
0
155
39
6
12
41
1.69
90937313--90937352
21
1.9
21
89
0
62
25
10
7
57
1.57
90937316--90937466
70
2.2
70
89
2
223
31
10
11
46
1.75
90937787--90937822
19
1.9
19
88
5
56
38
2
5
52
1.39
90937787--90937835
19
2.7
18
84
9
55
40
2
4
53
1.32
90939219--90939288
18
3.8
19
68
19
51
45
1
7
45
1.39
90939838--90939933
47
2.1
46
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115
62
2
6
29
1.31
90944706--90944888
50
3.7
49
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7
253
38
1
5
54
1.34
90944756--90944832
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2
2
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1.29
90944684--90944889
99
2.1
99
100
0
412
37
1
4
55
1.32
90947797--90947978
46
3.9
47
78
12
180
23
28
19
29
1.98
90947758--90947979
46
4.8
44
76
13
146
23
29
19
27
1.98
90949964--90950001
14
2.9
13
81
11
51
57
10
13
18
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90965592--90965651
30
2.0
30
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0
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40
25
3
31
1.72
90989544--90989592
22
2.2
21
79
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42
2
0
55
1.11
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10
5.1
10
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11
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34
0
1
63
1.06
90989554--90989597
22
2.0
22
95
0
79
38
0
0
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0.96
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2.0
21
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11
23
4
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1.50
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2.0
26
100
0
106
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20
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1.92
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1.99
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0
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1.94
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10
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22
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2
66
1.29
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2.0
38
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2
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3.5
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7
191
26
18
26
29
1.98
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1.9
18
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0
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20
0
34
1.51
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4.7
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11
211
25
26
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25
2.00
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22
2.0
22
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35
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30
1.91
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22
2.0
22
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2.2
20
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0
50
37
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2
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1.63
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22
2.0
22
100
0
88
40
9
18
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1.81
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17
2.1
17
100
0
70
48
11
22
17
1.79
91089880--91089943
9
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9
75
10
56
35
3
0
60
1.12
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21
2.2
21
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40
0
2
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1.11
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29
2.1
29
90
0
93
55
3
5
36
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91110949--91110975
11
2.5
11
100
0
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59
0
11
29
1.32
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15
2.0
15
93
0
51
56
6
0
36
1.26
91127956--91127992
14
2.6
14
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0
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54
2
2
40
1.29
91128993--91129041
24
2.0
24
84
0
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16
12
40
30
1.85
91132699--91132733
11
3.1
11
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4
52
34
8
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211
2.0
211
97
0
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19
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28
1.98
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40
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1
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28
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2.3
122
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23
28
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1.99
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6
100
0
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0
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27
2.5
27
92
0
116
17
29
35
16
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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