Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  29  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8137672--8137703
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0
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5.0
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4
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2.0
17
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2.1
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2.5
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25
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5
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3.7
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95
0
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9
27
57
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
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1.9
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175
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2
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6
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1.45
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3.2
30
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0
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3.4
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252
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18
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30
1.92
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150
3.9
151
81
11
624
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20
16
29
1.95
8248252--8248845
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7.8
75
80
10
595
33
21
16
28
1.95
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71
1.9
71
88
2
206
31
17
15
35
1.92
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159
2.3
152
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417
34
18
16
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1.93
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2.5
88
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400
35
18
16
30
1.92
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3.6
74
85
8
352
31
20
15
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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3.4
13
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4
8
15
1.28
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199
1.9
199
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573
38
18
18
23
1.93
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2.3
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2
230
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1.95
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90
2.0
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6
235
36
17
17
28
1.93
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4.3
15
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1
2
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1.15
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23
2.9
20
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15
59
56
5
6
31
1.47
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25
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1.48
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1.9
25
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60
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4
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18
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2.8
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260
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10
14
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2.3
24
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0
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0
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4
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22
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32
1.55
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20
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2.5
42
84
1
124
19
18
23
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8281778--8281868
43
2.1
43
85
4
121
23
26
23
27
2.00
8293954--8294002
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2.4
21
80
12
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53
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8
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1.55
8302479--8302542
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6.5
10
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20
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1
1
60
1.15
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1.9
17
94
5
59
26
0
0
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2.8
33
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33
23
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1.88
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2.0
13
100
0
52
38
7
7
46
1.61
8323387--8323495
33
3.3
33
90
2
157
30
22
9
38
1.85
8324214--8324261
21
2.2
22
82
14
64
35
16
0
47
1.47
8331104--8331204
43
2.3
43
83
3
123
29
17
22
29
1.97
8334141--8334515
186
2.0
186
98
0
732
36
5
16
42
1.72
8340368--8340521
53
2.9
52
74
15
143
34
14
24
26
1.94
8341467--8341494
13
2.2
13
100
0
56
7
35
39
17
1.78
8347940--8348090
53
2.8
52
80
8
162
29
16
25
27
1.97
8362125--8362164
16
2.5
16
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0
62
45
2
5
47
1.38
8368364--8368405
14
3.0
14
82
0
57
19
9
33
38
1.84
8375598--8375624
14
1.9
14
100
0
54
59
11
7
22
1.56
8378117--8378169
26
2.0
27
85
10
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77
0
7
15
0.98
8390937--8390962
13
2.0
13
100
0
52
61
7
0
30
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1
100
0
52
0
0
0
100
0.00
8415772--8415822
25
2.0
25
100
0
102
27
7
7
56
1.55
8422654--8422698
19
2.3
20
84
3
56
71
2
4
22
1.15
8425089--8425156
3
22.3
3
71
14
50
27
7
2
61
1.37
8425128--8425175
19
2.6
17
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12
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31
12
4
52
1.58
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3
9.3
3
100
0
56
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0
0
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0.91
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11
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12
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11
58
47
0
52
0
1.00
8430207--8430275
35
2.0
35
100
0
138
20
11
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17
1.76
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13
5.2
13
77
7
75
30
7
26
35
1.84
8437400--8437463
26
2.5
25
84
5
92
28
7
28
35
1.85
8441684--8441722
11
3.5
11
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6
60
66
2
2
28
1.18
8441715--8441760
15
3.0
16
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9
60
45
0
2
52
1.13
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38
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39
67
17
114
43
2
4
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1.37
8441829--8441880
15
3.6
15
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12
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44
0
1
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1.11
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15
3.6
15
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12
56
44
0
1
53
1.11
8441713--8442115
120
3.4
120
97
0
763
42
1
4
50
1.34
8441896--8442083
61
3.1
61
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17
210
42
2
5
50
1.39
8442077--8442118
15
2.7
16
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14
52
45
0
2
52
1.13
8442068--8442109
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
8442345--8442396
16
3.2
16
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5
61
21
32
3
42
1.71
8443796--8443830
3
11.7
3
93
0
61
28
0
2
68
1.04
8446014--8446074
24
2.5
24
80
20
65
44
6
0
49
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8456377--8456416
21
1.9
21
94
0
71
42
2
10
45
1.51
8456553--8456612
17
3.4
18
80
13
72
40
0
6
53
1.27
8458609--8458665
29
2.0
29
100
0
114
21
33
21
24
1.97
8464185--8464241
24
2.4
24
88
8
82
50
22
0
26
1.49
8465064--8465141
21
3.6
21
87
3
111
33
25
25
15
1.95
8465052--8465153
21
4.7
22
80
7
75
34
23
24
17
1.96
8465420--8465511
44
2.1
44
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4
114
30
23
22
22
1.99
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25
2.1
25
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0
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1.80
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20
2.0
20
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2
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1.42
8469510--8469633
64
1.9
64
95
0
221
49
3
8
39
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333