Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.20
Indices
Period
Size
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Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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21
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0
55
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5428078--5428134
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2
219
41
13
12
31
1.83
5457735--5457814
12
6.4
12
71
21
58
33
2
1
62
1.16
5457720--5457821
51
2.0
51
94
0
177
34
3
0
60
1.21
5457939--5457979
18
2.4
17
84
8
57
65
0
0
34
0.93
5463765--5463794
14
2.1
14
93
0
51
30
6
23
40
1.80
5464664--5464706
22
2.0
22
85
0
59
55
0
4
39
1.20
5469159--5469203
16
2.8
16
82
0
63
60
13
0
26
1.34
5470493--5470526
15
2.2
16
89
5
52
47
0
2
50
1.16
5472775--5472889
44
2.6
44
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2
149
36
13
21
27
1.92
5472775--5472908
46
3.0
45
82
6
137
35
14
23
26
1.93
5478401--5478712
148
2.1
147
79
6
344
40
10
8
40
1.70
5478976--5479057
43
1.9
43
82
9
105
32
3
10
52
1.54
5482012--5482036
10
2.5
10
100
0
50
12
28
0
60
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5483957--5484008
25
2.1
25
100
0
104
40
7
19
32
1.80
5493288--5493328
17
2.4
17
81
18
50
26
2
0
70
0.99
5504211--5504261
22
2.3
21
76
6
57
47
7
0
45
1.32
5504433--5504494
27
2.2
29
80
11
76
40
0
1
58
1.08
5506037--5506077
21
1.9
22
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5
57
63
7
0
29
1.21
5509643--5509688
24
1.9
24
86
0
65
47
2
0
50
1.13
5514400--5514431
17
2.0
17
88
11
50
25
15
18
40
1.90
5516893--5516947
13
4.2
13
81
11
60
74
3
0
21
0.97
5520366--5520415
19
2.8
18
77
16
50
8
0
34
58
1.28
5520404--5520448
17
2.7
16
86
3
54
8
2
44
44
1.47
5527056--5527093
10
3.8
10
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13
51
76
2
0
21
0.91
5527055--5527101
20
2.3
20
82
7
60
76
4
0
19
0.95
5529454--5529505
26
2.0
26
100
0
104
42
15
3
38
1.65
5537985--5538054
35
2.0
35
91
0
113
28
15
14
41
1.86
5553059--5553101
18
2.4
18
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7
52
41
2
0
55
1.12
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16
2.4
16
82
8
51
42
0
5
52
1.24
5565335--5565364
15
1.9
16
93
6
53
53
6
3
36
1.44
5569106--5569145
21
1.9
21
84
0
53
22
57
15
5
1.57
5569325--5569361
18
2.0
19
89
5
58
13
8
5
72
1.24
5570016--5570068
25
2.2
23
83
12
63
26
11
3
58
1.49
5570136--5570184
23
2.1
23
85
7
64
18
6
10
65
1.43
5573010--5573048
17
2.2
18
90
4
62
56
12
5
25
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5573583--5573642
10
6.0
10
73
7
50
78
0
8
13
0.96
5573598--5573633
8
4.5
8
92
0
54
80
0
2
16
0.83
5573598--5573646
16
3.2
16
77
8
57
79
0
4
16
0.88
5574224--5574321
50
2.0
50
97
0
187
39
9
10
40
1.71
5587338--5587392
19
2.7
20
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11
67
29
3
3
63
1.28
5587960--5588017
29
2.0
30
82
3
73
56
5
0
37
1.21
5589005--5589052
24
2.0
24
100
0
96
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1.90
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5.3
18
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19
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4
1
32
1.21
5590053--5590093
20
2.1
19
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13
57
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4
0
29
1.13
5590043--5590123
28
2.9
26
76
18
83
61
3
1
33
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333