Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  288  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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36
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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12
126
28
26
19
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95346176--95346217
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21
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0
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12
62
56
2
33
8
1.41
95388984--95389038
27
2.0
27
86
6
76
72
7
3
16
1.21
95393069--95393320
40
6.3
40
92
1
323
24
28
21
25
1.99
95393142--95393373
80
2.9
80
87
6
276
23
28
22
26
1.99
95393107--95393373
120
2.2
120
81
7
310
24
28
21
25
1.99
95393305--95393382
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
95395829--95395927
49
2.0
48
90
1
153
19
36
8
36
1.81
95396850--95396907
28
2.1
28
100
0
116
31
24
13
31
1.94
95403507--95403531
13
1.9
13
100
0
50
32
8
4
56
1.47
95410495--95410609
18
6.3
18
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6
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40
13
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36
1.76
95410635--95410686
18
2.8
19
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5
61
48
11
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30
1.72
95410802--95410832
6
5.2
6
96
0
53
48
16
19
16
1.81
95410920--95410944
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
95411072--95411126
21
2.5
23
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14
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40
7
0
52
1.29
95411398--95411511
57
2.0
57
98
0
219
28
22
11
37
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95412027--95412064
15
2.5
15
91
4
58
0
31
0
68
0.90
95429457--95429488
15
2.1
15
100
0
64
31
6
9
53
1.58
95429587--95429617
16
1.9
16
100
0
62
35
12
12
38
1.82
95429700--95429732
15
2.2
15
94
0
57
36
6
3
54
1.41
95437469--95437644
46
3.8
46
80
11
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21
19
29
29
1.98
95437466--95437637
93
1.8
93
95
2
310
21
20
29
28
1.98
95444433--95444493
24
2.5
24
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0
86
22
16
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1.96
95448690--95448755
30
2.2
29
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7
87
24
36
27
12
1.91
95452172--95452224
21
2.5
21
81
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75
7
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5
1.18
95452185--95452221
10
3.5
11
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10
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72
8
10
8
1.27
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9
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9
100
0
52
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0
0
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1.00
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2.0
21
100
0
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4
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53
1.55
95476608--95476641
6
5.8
6
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6
52
2
11
0
85
0.71
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3.2
11
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4
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2
11
0
86
0.68
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3.4
12
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0
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0.81
95478076--95478142
26
2.5
26
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2
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1.20
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3
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0
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0
0
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3
20.7
3
100
0
124
32
0
0
67
0.91
95486278--95486314
15
2.5
15
90
0
56
13
2
70
13
1.28
95486274--95486314
18
2.3
18
82
0
55
17
2
68
12
1.31
95488717--95488743
11
2.5
11
100
0
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44
25
11
18
1.83
95494013--95494043
11
2.8
11
95
0
53
29
3
48
19
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95498097--95498183
36
2.4
36
96
0
156
32
13
24
29
1.94
95498097--95498189
18
5.2
18
88
0
132
31
15
24
29
1.95
95498733--95498763
11
2.8
11
95
0
53
29
3
48
19
1.64
95499356--95499390
13
2.8
12
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8
52
25
8
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1.64
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15
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52
4
0
42
1.22
95510895--95510945
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2.3
22
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1.39
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0
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0
16
0
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1.82
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112
40
1
26
32
1.63
95525247--95525547
154
2.0
154
91
2
489
31
11
10
46
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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