Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  306  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100613682--100613813
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3.1
43
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1
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2.2
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0
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
185
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4.4
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4
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20
16
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1.95
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2.0
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100
0
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14
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17
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2.3
74
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4
216
36
18
17
27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.93
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14
2.5
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60
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16
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1.93
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162
2.1
162
89
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520
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16
24
1.93
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34
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15
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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18
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2.3
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86
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36
21
18
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1.95
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21
14
32
1.92
100669019--100669186
72
2.3
72
87
2
239
41
21
14
22
1.89
100669061--100669307
122
2.0
124
88
3
365
39
22
14
23
1.91
100669186--100669361
71
2.5
70
83
3
203
34
22
14
27
1.94
100677403--100677450
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
100677399--100677454
24
2.3
24
81
6
69
66
1
1
30
1.12
100677399--100677450
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
100677604--100677668
25
2.8
24
83
6
80
52
6
7
33
1.55
100677657--100677722
34
2.0
33
84
3
87
57
3
4
34
1.34
100677691--100677747
25
2.3
25
84
0
69
59
1
3
35
1.25
100677678--100677722
16
2.7
18
80
13
51
60
0
2
37
1.09
100677781--100677826
25
1.9
25
86
8
69
60
0
4
34
1.16
100678312--100678484
30
5.8
30
90
0
265
24
3
46
24
1.68
100678312--100678486
60
2.9
60
93
0
305
24
3
46
25
1.68
100678959--100678997
21
1.9
20
84
5
51
53
17
0
28
1.44
100680595--100680650
22
2.6
22
83
5
62
51
0
0
48
1.00
100682587--100682646
27
2.2
28
93
3
104
50
8
13
28
1.70
100683024--100683151
48
2.6
48
79
9
134
31
20
25
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100683131--100683215
26
3.3
26
73
3
93
35
15
25
23
1.94
100683278--100683334
24
2.3
25
79
8
64
36
22
24
15
1.94
100683857--100683897
20
2.1
20
86
4
57
34
7
2
56
1.40
100684982--100685010
14
2.1
14
100
0
58
75
6
0
17
1.01
100685137--100685161
13
1.9
13
100
0
50
48
0
36
16
1.46
100685099--100685299
76
2.7
75
82
10
223
36
2
39
21
1.67
100688463--100688503
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
100697024--100697113
9
9.9
9
78
15
71
26
2
2
68
1.12
100697027--100697113
15
6.0
14
75
20
72
26
2
2
68
1.13
100697066--100697107
13
3.1
13
86
10
57
26
0
0
73
0.83
100697057--100697113
22
2.4
25
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13
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28
0
0
71
0.86
100697051--100697107
28
2.0
28
83
12
73
26
0
1
71
0.95
100698665--100698699
17
2.1
17
100
0
70
54
11
22
11
1.68
100701786--100701829
20
2.2
20
100
0
88
11
45
18
25
1.82
100703613--100703650
14
2.6
16
84
16
55
31
7
2
57
1.41
100704507--100704537
12
2.6
12
94
0
53
6
22
29
41
1.78
100708883--100708922
21
2.0
20
85
5
53
75
2
10
12
1.15
100710936--100710977
5
8.2
5
89
10
59
42
0
0
57
0.99
100711247--100711294
20
2.3
20
79
10
53
79
0
14
6
0.92
100711256--100711309
15
3.5
15
78
12
56
74
3
16
5
1.16
100712708--100712756
20
2.5
20
74
12
55
61
0
6
32
1.21
100712882--100712906
12
2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100712937--100713053
47
2.5
47
88
5
166
16
17
23
42
1.88
100713181--100713266
18
4.7
18
79
1
91
36
10
12
40
1.78
100713178--100713266
36
2.4
37
81
5
110
35
11
13
39
1.80
100715197--100715323
27
4.7
27
87
1
184
27
23
10
38
1.87
100715197--100715324
53
2.4
54
86
2
186
28
23
10
38
1.87
100715340--100715439
27
3.7
27
89
1
148
42
20
8
30
1.80
100715317--100715440
54
2.3
55
84
5
164
41
21
7
29
1.80
100715427--100715655
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27
85
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282
36
18
18
26
1.94
100715432--100715655
54
4.1
54
88
2
315
36
18
19
25
1.95
100715878--100715972
25
3.8
25
91
0
154
27
26
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333