Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  280  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92711293--92711385
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92711293--92711395
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1.61
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92714192--92714278
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25
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5
34
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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92784216--92784608
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96
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1.87
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2.0
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24
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92807324--92807677
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174
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23
21
27
1.99
92819302--92819499
25
8.1
23
84
11
252
27
23
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10.8
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0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92843011--92843070
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34
2.2
34
90
0
116
28
22
22
26
1.99
92902151--92902308
46
3.4
45
79
5
163
31
18
25
24
1.98
92902338--92902467
49
2.7
49
79
7
140
30
20
26
23
1.98
92920466--92920628
46
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45
86
8
215
33
18
26
22
1.97
92920668--92920778
49
2.3
49
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6
127
30
22
26
20
1.98
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2.0
30
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0
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6
16
1.73
92923422--92923472
25
2.0
25
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0
93
23
31
7
37
1.83
92925308--92925359
18
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19
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9
34
1.53
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5
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2
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0
0
58
0.98
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12
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40
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6
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27
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24
2.00
92933624--92933808
79
2.3
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79
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209
26
27
22
24
2.00
92941543--92941727
40
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40
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7
209
25
27
22
24
2.00
92941571--92941674
39
2.6
40
90
1
165
26
28
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92941571--92941724
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1.9
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84
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25
28
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24
1.99
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30
2.2
30
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1.98
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2.0
43
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1.68
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18
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19
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0
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0
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0
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0
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23
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2.0
55
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2.0
20
100
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20
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5.4
12
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15
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36
0
4
59
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92970009--92970074
3
21.7
3
75
14
55
36
0
4
59
1.18
92970009--92970071
16
3.9
16
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8
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36
0
4
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1.19
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2.6
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1
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1.28
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0
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40
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0
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1.80
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18
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0
0
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58
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204
2.0
201
83
4
507
23
19
13
43
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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