Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  13  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
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184
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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2.1
28
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0
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12
32
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3792419--3792460
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1.93
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17
19
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1.95
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388
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15
18
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31
28
12
27
1.93
3808715--3808765
23
2.2
23
100
0
102
29
3
3
62
1.31
3820830--3820896
22
2.8
24
82
13
84
19
1
25
53
1.53
3829419--3829453
3
11.7
3
100
0
70
68
0
0
31
0.90
3830547--3830585
20
1.9
21
85
15
55
53
0
2
43
1.14
3831652--3831737
30
2.9
30
92
0
136
27
3
12
55
1.53
3836004--3836072
31
2.1
31
84
7
84
40
5
8
44
1.59
3838405--3838429
13
1.9
13
100
0
50
32
8
8
52
1.60
3847749--3847802
25
2.2
25
93
0
90
37
22
14
25
1.93
3849954--3850046
43
2.2
44
92
3
154
51
13
6
27
1.66
3850068--3850107
19
2.2
18
90
4
62
42
17
2
37
1.63
3856812--3856904
43
2.2
44
92
3
154
51
13
6
27
1.66
3856926--3856965
19
2.2
18
90
4
62
42
17
2
37
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3857965--3858002
18
2.2
18
85
4
51
52
0
13
34
1.40
3858958--3859079
61
2.0
61
95
0
217
23
13
31
31
1.93
3865799--3865833
17
2.1
17
100
0
70
48
11
5
34
1.63
3867318--3867353
17
2.1
18
94
5
65
27
5
0
66
1.13
3872112--3872158
6
7.8
6
90
0
58
40
2
53
4
1.32
3872996--3873032
2
18.5
2
100
0
74
0
51
0
48
1.00
3876254--3876467
9
22.3
9
68
18
87
59
4
3
31
1.35
3876251--3876397
19
7.7
19
71
15
72
59
3
4
33
1.33
3876251--3876352
38
2.7
36
73
14
98
62
3
3
29
1.31
3876326--3876381
29
1.9
29
85
0
76
58
1
3
35
1.26
3880232--3880281
20
2.5
20
83
3
64
66
4
20
10
1.38
3882254--3882483
116
2.0
116
83
5
295
29
11
22
36
1.89
3885500--3885534
18
1.9
18
88
11
54
37
2
0
60
1.12
3917717--3917843
64
2.0
64
98
0
245
25
18
17
39
1.92
3918886--3918917
16
2.0
16
100
0
64
31
18
12
37
1.88
3919923--3919955
15
2.1
16
88
5
50
33
0
3
63
1.10
3924197--3924239
20
2.1
21
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4
61
46
0
0
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1.00
3925221--3925290
25
3.0
25
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14
78
44
2
0
52
1.15
3925276--3925398
25
4.8
26
71
20
80
33
3
3
60
1.29
3931162--3931203
22
1.9
22
85
0
57
47
2
2
47
1.28
3932166--3932207
18
2.3
18
84
11
59
66
2
0
30
1.04
3945445--3945568
66
1.9
65
88
5
187
33
13
12
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3950999--3951039
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
3957326--3957366
15
2.5
17
80
11
59
63
0
2
34
1.08
3957317--3957366
24
2.0
26
84
7
68
60
0
2
38
1.09
3970354--3970437
31
2.8
29
81
7
78
40
2
10
46
1.52
3970599--3970655
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1.9
29
86
10
80
50
7
3
38
1.46
3977477--3977511
15
2.3
15
95
0
61
34
8
0
57
1.29
3977451--3977509
12
4.8
12
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4
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30
8
0
61
1.26
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15
3.1
15
90
0
58
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10
0
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1.35
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2.7
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14
115
29
19
20
30
1.97
3990377--3990532
85
1.9
82
82
6
197
30
21
23
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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