Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  210  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68892102--68892138
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0
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51
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0
0
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0
100
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2.3
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2.3
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192
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25
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26
1.91
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3.2
23
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23
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29
10
32
28
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.91
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1.83
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20
19
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1.96
68974152--68974251
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2.2
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130
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21
19
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68974173--68974271
46
2.2
46
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7
121
28
21
18
32
1.96
68974185--68974271
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17
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1.96
68986617--68986701
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3.0
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2.0
21
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1.98
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3.0
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482
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25
6
36
1.82
69011685--69011976
48
5.9
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440
31
25
6
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1.82
69011688--69011976
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149
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29
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22
1.99
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1.9
36
91
2
115
26
29
19
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
1.82
69017271--69017607
148
2.3
146
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1
604
31
25
6
36
1.82
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23
14
39
1.91
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2.9
15
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25
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60
1.49
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2.4
16
100
0
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1.42
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1.98
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51
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30
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1.87
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30
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1.87
69026930--69027246
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463
29
30
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32
1.87
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1.04
69094266--69094308
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11
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20
2
2
74
1.04
69103546--69103599
19
2.7
20
81
16
58
38
7
1
51
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69103564--69103603
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1.9
20
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37
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0
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1.35
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82
11
263
24
31
17
26
1.97
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254
24
30
19
25
1.98
69106075--69106443
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2.6
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18
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1.98
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4
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36
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14
32
1.89
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32
16
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1.86
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39
6.6
39
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311
25
27
21
25
1.99
69124883--69124985
27
3.7
28
84
5
129
30
27
5
36
1.80
69124881--69124985
55
1.9
55
84
3
140
30
26
5
37
1.80
69124963--69125095
27
4.9
28
77
9
123
39
22
7
30
1.82
69124871--69124995
55
2.3
55
77
4
135
33
26
5
34
1.80
69124963--69125095
55
2.4
56
76
7
139
39
22
7
30
1.82
69125073--69125167
28
3.4
27
81
7
118
28
18
8
44
1.79
69125251--69125326
26
2.9
25
75
7
71
40
21
5
32
1.75
69126128--69126213
20
4.3
20
89
5
131
39
9
18
32
1.83
69126128--69126213
39
2.2
40
89
6
131
39
9
18
32
1.83
69126262--69126350
26
3.5
26
89
3
135
30
17
22
29
1.97
69127829--69128050
40
5.6
40
81
10
226
25
27
22
24
2.00
69127829--69128004
40
4.5
39
86
5
230
26
27
20
25
1.99
69127829--69127998
79
2.2
78
87
3
243
26
28
21
24
1.99
69127829--69128047
79
2.8
78
81
5
210
25
27
21
24
1.99
69135707--69135926
40
5.7
40
85
7
267
24
28
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69135709--69135926
114
1.9
118
83
7
286
23
27
22
25
2.00
69143591--69143760
40
4.3
40
90
3
240
25
27
21
24
1.99
69143747--69143785
19
2.1
19
100
0
78
28
25
15
30
1.96
69145902--69146103
102
2.0
102
96
1
370
42
5
17
34
1.74
69146410--69146493
22
3.7
22
84
10
100
25
21
17
35
1.95
69146378--69146515
23
5.9
23
79
8
120
23
21
20
34
1.97
69150555--69150819
46
5.7
46
74
14
249
22
21
27
28
1.99
69150551--69150810
93
2.8
93
92
0
432
22
21
28
27
1.99
69156790--69156873
23
3.7
23
69
15
66
23
19
20
36
1.95
69171424--69171491
26
2.6
26
97
0
127
23
23
29
23
1.99
69175027--69175120
30
3.1
30
93
1
152
25
25
6
42
1.78
69175037--69175114
15
5.2
15
70
11
70
25
23
7
43
1.80
69179690--69179813
30
4.1
30
91
1
194
25
23
6
44
1.77
69179700--69179807
15
7.2
15
65
12
69
25
21
7
45
1.78
69180459--69180517
27
2.1
28
90
3
93
37
1
0
61
1.07
69180478--69180551
22
3.5
22
76
10
73
37
0
1
60
1.05
69181071--69181129
28
2.1
28
81
6
66
52
3
1
42
1.28
69181479--69181505
4
6.8
4
100
0
54
22
0
0
77
0.76
69187014--69187050
19
1.9
19
88
0
56
51
2
8
37
1.46
69187258--69187291
13
2.5
14
90
4
52
29
20
5
44
1.75
69192477--69192855
144
2.6
144
86
1
508
24
28
18
28
1.98
69192477--69192838
48
7.5
48
82
4
401
24
28
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69195668--69195711
20
2.3
18
81
11
52
40
0
20
38
1.53
69196345--69196511
46
3.6
46
76
10
171
31
19
26
22
1.98
69196345--69196555
48
4.5
47
78
10
184
31
19
26
22
1.98
69196345--69196555
93
2.3
94
83
6
259
31
19
26
22
1.98
69224635--69225014
48
7.9
48
80
4
383
23
28
19
28
1.98
69224635--69225015
144
2.6
144
87
2
523
23
28
19
28
1.98
69227738--69227779
18
2.4
17
84
11
57
7
21
2
69
1.25
69247420--69247470
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1.9
26
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4
75
45
11
7
35
1.70
69248892--69248935
18
2.4
17
85
14
61
63
0
2
34
1.07
69265261--69265367
39
2.7
40
88
1
144
27
27
20
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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