Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  74  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22765574--22765738
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19
16
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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332
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2.0
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2.6
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0
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16
25
18
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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2.2
26
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144
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28
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3.2
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23
22
19
1.96
22933884--22933959
28
2.8
27
82
4
82
31
10
21
36
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22935401--22935508
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4.2
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7
34
1.82
22935401--22935508
52
2.1
52
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36
22
7
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1.82
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16
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25
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169
28
18
29
23
1.98
22957539--22957895
48
7.5
49
70
11
149
27
18
29
24
1.98
22959395--22959444
24
2.1
23
85
3
64
68
4
2
26
1.18
22959853--22959935
39
2.1
39
84
4
114
31
38
10
19
1.86
22962238--22962305
5
13.6
5
72
17
52
63
4
0
32
1.14
22962274--22962306
8
4.2
8
88
7
50
66
0
0
33
0.92
22962414--22962446
15
2.2
15
89
10
50
66
0
0
33
0.92
22971320--22971358
3
13.0
3
100
0
78
0
33
0
66
0.92
22972810--22972856
23
2.0
23
100
0
94
29
8
27
34
1.87
22976751--22976795
22
2.0
22
100
0
90
53
24
8
13
1.68
22979283--22979363
33
2.5
33
83
0
99
28
22
19
29
1.98
22979397--22979451
18
3.1
18
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19
60
45
21
9
23
1.80
22983114--22983222
25
4.4
25
71
9
87
27
13
19
39
1.89
22983136--22983266
50
2.6
50
85
3
167
28
11
21
38
1.88
22983551--22983615
32
2.0
32
93
0
112
26
4
33
35
1.77
22988926--22988955
15
1.9
16
93
6
53
36
6
3
53
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22993559--22993638
8
9.9
8
74
15
67
32
0
5
62
1.17
22993562--22993606
14
3.1
14
81
6
54
31
0
4
64
1.13
22993554--22993638
15
5.3
15
71
17
64
35
0
4
60
1.18
22993561--22993613
22
2.3
23
80
3
63
32
0
3
64
1.12
22994942--22994977
18
2.0
18
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0
54
22
33
11
33
1.89
22994960--22995047
40
2.2
40
89
4
133
22
23
22
30
1.99
22997607--22997631
12
2.1
12
100
0
50
32
8
16
44
1.76
22998953--22998991
18
2.3
18
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43
12
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38
1.65
22999148--22999178
15
2.1
15
93
0
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22
29
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1.78
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2.0
15
93
0
51
23
46
6
23
1.75
23003310--23003348
18
2.3
18
86
8
55
43
12
5
38
1.65
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15
2.1
15
100
0
62
22
32
6
38
1.80
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27
5.9
27
80
11
166
35
22
23
18
1.95
23005642--23005782
54
2.6
54
90
2
230
36
23
22
17
1.95
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26
6.2
26
89
0
239
36
22
8
33
1.84
23011068--23011508
47
9.4
47
92
1
704
28
30
8
32
1.86
23016186--23016216
16
1.9
16
93
0
53
25
3
9
61
1.42
23017185--23017343
27
5.9
27
82
10
173
35
22
23
18
1.96
23017203--23017343
54
2.6
54
93
2
239
35
23
23
17
1.95
23018965--23019124
26
6.2
26
91
0
257
36
23
6
33
1.80
23023336--23023376
4
10.8
4
84
10
59
75
0
0
24
0.80
23023513--23023551
16
2.3
17
86
8
53
48
33
10
7
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23024576--23024635
22
2.6
23
82
12
61
28
5
0
66
1.12
23024696--23024731
18
2.1
18
94
5
65
38
2
0
58
1.13
23024714--23024757
12
3.6
12
84
3
52
31
6
0
61
1.22
23033394--23033462
33
2.1
33
97
0
129
30
21
21
26
1.99
23035853--23035973
64
1.9
65
86
5
174
37
7
4
51
1.49
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14
2.3
14
100
0
64
12
0
21
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1.25
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79
2.8
78
82
9
265
24
27
22
25
2.00
23049256--23049478
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5.7
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8
266
24
27
22
25
2.00
23057239--23057459
79
2.8
77
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11
252
24
27
21
25
1.99
23057239--23057461
39
5.7
40
84
10
259
25
27
21
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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