Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  157  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2.1
33
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18
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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T
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(0-2)
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22
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4.2
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122
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23
22
38
1.93
51393110--51393222
54
2.1
54
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147
16
23
22
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2.1
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29
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30
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1.94
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2.0
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2.0
21
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4.8
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1.98
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1
388
34
10
31
24
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1.99
51487065--51487246
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4.6
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194
24
20
28
26
1.99
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79
2.2
79
81
12
208
26
19
26
26
1.99
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35
17
25
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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63
1.28
51630084--51630114
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
51630081--51630120
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
51630366--51630560
55
3.6
53
82
6
214
21
25
17
35
1.95
51632029--51632200
93
1.8
93
92
0
290
29
29
20
20
1.98
51632021--51632196
46
3.8
46
77
15
191
30
29
19
20
1.97
51634304--51634349
23
2.0
23
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12
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45
10
6
36
1.65
51634311--51634355
23
2.0
23
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8
56
40
13
8
37
1.76
51636358--51636409
25
2.1
25
100
0
104
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7
28
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20
2.3
20
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0
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30
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39
1.75
51643300--51643497
55
3.7
52
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9
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21
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0
24
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1.28
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2.1
26
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0
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22
24
25
2.00
51652660--51652706
24
2.0
24
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0
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4
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1.64
51653079--51653105
13
2.1
13
100
0
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29
0
14
55
1.40
51653877--51653921
23
2.0
23
86
0
63
31
4
0
64
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51659083--51659127
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2.2
21
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11
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31
2
4
62
1.27
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3
8.7
3
100
0
52
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0
0
34
0.93
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14
2.5
14
90
0
52
48
5
14
31
1.67
51662296--51662563
134
2.0
134
99
0
527
41
17
11
29
1.85
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2
17.5
2
93
0
52
0
5
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45
1.26
51677931--51677990
25
2.3
27
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1
13
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1.52
51677931--51677995
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1
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1.52
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0
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15
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43
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138
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14
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2.1
23
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0
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17
2.8
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0
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23
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2.1
16
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60
0
3
36
1.12
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5
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33
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20
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2.3
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83
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24
27
22
24
2.00
51743295--51743498
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5.1
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229
24
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22
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2.00
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47
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0
183
28
30
7
34
1.84
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20
2.0
20
100
0
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10
35
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51751789--51752000
40
5.3
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248
24
20
27
27
1.99
51751793--51752009
80
2.7
79
88
3
310
24
21
27
26
1.99
51759854--51760065
40
5.3
40
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2
248
24
20
27
27
1.99
51759858--51760074
80
2.7
79
88
3
310
24
21
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51769345--51769386
21
2.0
21
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13
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54
4
11
28
1.57
51771079--51771176
40
2.4
41
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3
162
20
26
7
45
1.76
51776187--51776225
20
2.0
20
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25
20
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5
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5
100
0
56
82
0
0
17
0.68
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2.6
25
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19
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1.98
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24
2.5
24
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1.94
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47
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1
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29
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1.87
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2
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29
29
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1.87
51805169--51805625
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3.2
145
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1
751
29
29
8
32
1.87
51808855--51809076
48
4.7
48
76
10
208
27
23
20
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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