Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  281  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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27
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1.99
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1.99
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27
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27
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2.9
45
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21
30
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
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2.0
251
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1.9
120
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21
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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23
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27
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
93210818--93210906
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59
3.0
59
68
16
176
42
1
5
51
1.32
93221256--93221487
120
1.9
122
98
1
450
41
1
6
49
1.39
93221266--93221452
61
3.1
61
70
14
206
42
1
7
48
1.41
93221443--93221490
15
3.1
16
82
14
57
45
0
2
52
1.12
93221443--93221472
16
1.9
15
93
6
51
43
0
0
56
0.99
93221616--93221725
45
2.6
43
79
11
120
32
29
5
32
1.80
93221706--93221773
16
4.2
16
90
0
109
35
35
0
29
1.58
93222540--93222598
29
2.0
29
100
0
118
30
32
6
30
1.83
93224078--93224319
94
2.6
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28
8
14
48
1.72
93224252--93224402
58
2.6
58
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0
257
26
7
12
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1.64
93224707--93224733
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0
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0
0
37
0.95
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26
2.0
26
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3
79
50
3
0
46
1.20
93231366--93231432
22
3.1
21
79
14
82
38
19
25
16
1.92
93231410--93231520
25
4.5
24
87
8
143
35
19
24
20
1.96
93231408--93231520
50
2.3
50
87
6
167
35
19
23
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93233383--93233480
49
2.0
49
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0
187
31
22
9
36
1.86
93239872--93239961
43
2.1
43
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0
117
26
23
31
18
1.98
93239891--93239981
43
2.1
43
91
0
146
23
23
34
19
1.97
93240976--93241205
48
4.9
48
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12
217
28
17
27
26
1.98
93240985--93241252
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5.7
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14
186
28
18
27
25
1.98
93240985--93241288
140
2.2
139
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2
414
27
18
27
25
1.98
93252139--93252164
6
4.3
6
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0
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19
19
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1.85
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1.8
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0
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21
20
1.98
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20
1.98
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0
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27
29
21
20
1.98
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3.8
46
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28
29
21
20
1.98
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27
3.5
28
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2
126
30
29
13
26
1.94
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1.8
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0
317
27
29
21
20
1.98
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3.8
46
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29
21
20
1.98
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2.2
12
100
0
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7
7
0
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11
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1.39
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2.0
22
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4
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55
0
2
42
1.12
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1.9
16
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43
0
16
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1.48
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3
100
0
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0
0
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0.93
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2.0
807
96
0
2986
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18
22
27
1.97
93319549--93319573
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2.1
12
100
0
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0
44
1.32
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157
1.9
157
87
0
441
33
16
20
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93321502--93321609
54
2.0
54
92
0
180
22
21
17
38
1.93
93322876--93322917
20
2.1
20
100
0
84
42
30
9
16
1.80
93330978--93331011
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2.0
17
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0
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50
0
5
1.26
93335618--93335651
17
2.0
17
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0
59
44
50
0
5
1.26
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4
100
0
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0
0
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17
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8
2
57
1.44
93348595--93348715
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2.3
52
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4
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23
26
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2.4
25
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0
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29
19
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1.98
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2.2
25
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0
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32
21
27
18
1.96
93353992--93354072
41
2.0
41
90
4
128
27
22
18
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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