Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  311  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101815612--101815636
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2.1
12
100
0
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52
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101819491--101819593
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12
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1.92
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3.9
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1.93
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4.3
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299
27
22
14
35
1.93
101820750--101821018
98
2.7
98
93
0
457
28
22
14
34
1.93
101825433--101825529
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2.1
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46
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2.0
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0
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2
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2.0
20
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3.0
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19
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2
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4.0
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88
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50
23
2
0
73
0.97
101847986--101848020
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2.7
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90
0
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22
5
0
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58
0
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1.38
101853564--101853592
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2.5
12
88
11
51
58
0
24
17
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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3
31.7
3
74
12
72
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6
2
30
1.32
101861969--101862049
25
3.2
26
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10
96
59
7
0
33
1.25
101861956--101862033
31
2.6
29
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15
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7
0
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2.3
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25
17
28
1.97
101873216--101873345
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2.2
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174
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23
16
30
1.97
101876865--101876911
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55
0
2
42
1.12
101903772--101903831
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2.3
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88
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0
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66
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101903772--101903829
9
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25
0
5
68
1.10
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2.9
17
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101920505--101920547
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11
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100
0
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33
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0
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2.2
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2.0
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0
1.54
101937600--101937660
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39
37
22
0
1.55
101937600--101937660
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2.3
27
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39
37
22
0
1.55
101937689--101937727
18
2.2
18
86
9
53
30
0
43
25
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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179
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16
36
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2.0
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0
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0
0
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28
30
1.66
101956593--101956664
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4.5
16
91
0
99
40
4
26
29
1.75
101966539--101966563
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2.1
12
100
0
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8
36
1.62
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27
2.1
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3
89
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1
10
49
1.48
101971881--101971923
19
2.2
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12
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4
0
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0
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102004093--102004261
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16
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102006325--102006393
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102007614--102007655
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2.2
19
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8
59
71
2
0
26
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102009748--102009789
19
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19
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59
30
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4
59
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4
0
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102016085--102016125
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57
14
4
0
80
0.87
102016085--102016125
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1.97
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2.0
111
87
0
320
27
17
25
29
1.97
102040115--102040320
45
4.7
44
70
10
143
25
21
23
28
1.99
102041298--102041383
37
2.3
37
93
0
145
22
23
25
29
1.99
102044154--102044293
25
5.6
25
83
2
149
32
24
25
17
1.97
102045043--102045090
18
2.8
17
84
9
62
77
12
0
10
1.00
102048454--102048481
13
2.2
13
100
0
56
21
14
0
64
1.29
102050744--102050786
20
2.2
20
100
0
86
13
4
34
46
1.65
102055958--102056092
41
3.3
41
91
4
211
29
23
19
27
1.98
102059025--102059399
120
3.2
119
86
2
515
18
20
30
31
1.96
102059426--102059454
6
4.8
6
100
0
58
0
31
51
17
1.45
102068693--102068793
50
2.0
50
100
0
202
33
15
19
30
1.94
102074271--102074296
12
2.2
12
100
0
52
23
7
23
46
1.78
102076700--102076739
14
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0
7
77
0.98
102084168--102084198
15
2.1
15
100
0
62
48
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0
32
1.49
102084552--102084714
77
2.1
77
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5
224
35
9
9
46
1.68
102087613--102087672
17
3.3
17
76
17
57
40
3
3
53
1.34
102087980--102088018
17
2.3
17
86
8
53
5
25
2
66
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102102002--102102090
44
2.0
43
86
2
124
37
7
4
50
1.52
102108634--102108772
69
2.0
69
98
0
269
26
12
32
28
1.93
102121868--102121966
33
3.0
33
93
0
171
31
41
10
17
1.82
102127745--102127792
25
1.9
25
84
16
64
70
6
14
8
1.31
102127862--102127895
17
1.9
17
88
5
50
44
14
11
29
1.81
102129014--102129066
16
3.4
16
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12
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50
1
0
47
1.12
102142045--102142105
31
2.0
30
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1
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1.44
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0
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0
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1.57
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15
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16
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16
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50
1
0
47
1.11
102143094--102143128
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2.0
17
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5
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54
0
0
45
0.99
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18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
102143109--102143299
61
3.2
60
67
20
155
48
5
2
43
1.38
102143072--102143355
120
2.4
120
90
2
446
48
4
1
44
1.34
102147866--102147912
24
2.0
24
100
0
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4
0
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12
2.3
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5
51
62
0
0
37
0.96
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26
2.9
24
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72
27
2
7
61
1.37
102149560--102149627
18
3.9
18
75
9
79
54
4
2
38
1.36
102151546--102151578
17
1.9
17
93
0
57
30
0
21
48
1.50
102151543--102151579
19
1.9
19
88
0
56
32
0
21
45
1.52
102151797--102151972
41
4.3
41
91
0
280
29
19
27
23
1.98
102151797--102151966
82
2.1
82
98
0
331
29
18
28
23
1.98
102159187--102159223
19
1.9
19
94
0
65
35
0
18
45
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102159437--102159612
41
4.3
41
91
0
280
29
19
27
23
1.98
102159437--102159606
82
2.1
82
98
0
331
29
18
28
23
1.98
102163361--102163391
16
1.9
16
93
0
53
38
0
3
58
1.15
102172201--102172272
35
2.1
35
94
0
126
50
8
6
34
1.60
102188643--102188705
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2.1
31
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0
0
52
1.00
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3.3
31
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17
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38
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15
33
1.86
102192347--102192402
27
1.9
30
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1.70
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0
0
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0.99
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2.0
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7
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1.76
102195808--102195859
27
1.9
27
84
0
68
26
25
21
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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