Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  25  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7199068--7199105
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2.0
19
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2
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7201581--7201688
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6
22
37
1.80
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4.2
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0
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2.9
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0
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2.0
164
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2.0
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1
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2.0
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100
0
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2.3
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2
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1.44
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2.9
25
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2.1
15
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0
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58
0
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5.2
11
75
16
52
55
6
3
34
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7234295--7234370
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2.8
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2.3
25
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0
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7234838--7234897
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2.3
27
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10
0
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2.0
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30
22
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2.1
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20
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20
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2.2
32
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20
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10
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2.1
17
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2.0
22
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22
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2
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2.0
23
100
0
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2.1
15
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0
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3
9
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1.53
7304468--7304520
22
2.4
22
79
17
56
62
0
3
33
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.1
25
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0
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17
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2
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2
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0
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3
51
0
1.16
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1.9
31
93
0
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50
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10
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1.75
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2.1
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55
10
0
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1.34
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2.3
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28
22
24
1.99
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40
5.1
40
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8
229
25
27
22
24
1.99
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79
2.3
80
78
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189
27
27
21
23
1.99
7331731--7331934
40
5.1
40
79
8
211
26
27
21
24
1.99
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9
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0
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170
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1
14
46
1.52
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4.4
105
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2
765
54
3
5
36
1.41
7336770--7337234
214
2.2
209
93
2
781
54
3
5
36
1.41
7340618--7340780
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2
202
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18
21
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2.0
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8
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0
0
50
1.00
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2.0
25
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4
73
22
12
8
57
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7345947--7345992
22
2.1
23
88
8
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30
0
8
60
1.26
7349019--7349384
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46
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13
22
22
1.89
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17
2.1
16
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0
0
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4.1
22
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15
69
22
0
6
70
1.11
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2.8
22
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25
0
6
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1.13
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16
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65
4
2
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1.22
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20
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0
4
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1.14
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17
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2
67
1.27
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2.5
74
84
3
230
43
11
15
29
1.82
7385748--7385851
54
1.9
54
90
0
163
49
15
7
27
1.72
7385675--7386009
127
2.6
127
82
5
383
44
12
11
31
1.78
7387624--7387658
17
2.1
17
100
0
70
45
5
11
37
1.64
7390367--7390526
80
2.0
81
93
3
279
26
24
21
26
1.99
7391452--7391558
43
2.5
42
81
3
124
32
22
14
30
1.93
7394043--7394113
11
6.6
10
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13
52
4
22
2
70
1.18
7394040--7394094
28
1.9
29
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3
76
1
27
3
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1.17
7394092--7394122
12
2.7
11
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9
53
9
16
0
74
1.07
7394393--7394421
13
2.1
14
93
6
51
48
6
0
44
1.29
7395850--7395896
15
3.3
15
79
5
53
31
0
6
61
1.21
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8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
7399637--7399715
29
2.6
31
77
13
94
62
3
0
34
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7407431--7407679
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
25
1.99
7407430--7407679
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
25
1.99
7407774--7407805
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
7417445--7417493
25
2.0
25
84
4
64
63
8
0
28
1.23
7417457--7417521
25
2.9
23
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15
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9
0
24
1.21
7417483--7417521
19
2.0
20
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5
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71
10
0
17
1.12
7419323--7419368
3
15.3
3
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0
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32
34
0
32
1.58
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27
2.2
25
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10
1
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1.43
7419444--7419523
41
2.0
41
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5
108
30
10
1
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1.38
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20
2.0
20
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0
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27
7
0
65
1.20
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2.3
27
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7
76
28
6
0
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1.16
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2.1
44
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0
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48
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18
1.80
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7.4
87
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2
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34
20
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21
1.96
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44
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9
293
34
19
23
22
1.97
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34
19
23
21
1.96
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262
2.5
259
88
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870
34
19
22
22
1.96
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18
2.5
17
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3
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27
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1.55
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3
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3
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13
78
29
9
0
60
1.35
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41
2.0
41
85
5
108
30
10
1
58
1.38
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14
2.3
15
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5
50
24
3
0
72
0.98
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23
5.4
23
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26
7
0
66
1.17
7434263--7434332
29
2.4
29
83
4
97
25
7
0
67
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7434480--7434514
18
1.9
18
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0
52
22
8
8
60
1.54
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17
3.1
16
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25
52
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1
0
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1.09
7438513--7438577
22
3.0
22
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13
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55
1
1
41
1.18
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0
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50
0
0
50
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0
0
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1.00
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0
0
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2.3
19
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4
70
34
0
0
65
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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