Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  314  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102763043--102763097
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0
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15
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0
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100
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0
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26
0
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66
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.97
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2.7
22
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61
26
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1.16
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2.1
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0
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2.2
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135
29
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30
1.96
102895518--102895582
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1.9
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35
20
18
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1.95
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75
31
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2
56
1.45
102900576--102900632
25
2.3
24
85
11
71
33
1
1
63
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
37
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2.3
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3
4
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1.9
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60
1.45
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20
2.0
20
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0
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2.1
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53
3
0
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1.16
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0
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0
0
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100
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0
0
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3.4
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0
175
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49
3
18
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102944884--102945028
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164
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1.69
102945516--102945647
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4
3
57
1.34
102945581--102945699
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4.5
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32
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4
55
1.47
102945530--102945736
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3.2
26
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0
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34
23
5
35
1.80
102952553--102952634
33
2.4
34
78
8
96
31
23
18
26
1.97
102954481--102954538
26
2.2
26
93
0
98
34
22
5
37
1.76
102957937--102957980
22
2.0
22
91
8
72
27
4
0
68
1.09
102958181--102958227
24
2.0
24
82
0
58
34
2
2
61
1.20
102958250--102958383
20
6.8
19
74
21
100
35
5
2
56
1.36
102958239--102958309
29
2.6
26
80
12
72
36
2
1
59
1.21
102958249--102958309
7
8.7
7
76
20
65
37
3
1
57
1.25
102958651--102958708
17
3.6
17
69
21
52
34
1
1
62
1.16
102974712--102974882
46
3.7
46
77
14
181
29
28
19
22
1.98
102974716--102974886
93
1.8
92
89
1
270
29
28
19
22
1.98
102976392--102976447
20
2.9
20
68
5
53
3
7
14
75
1.16
102977200--102977556
76
4.8
72
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8
360
33
20
15
30
1.93
102977200--102978315
71
15.4
74
73
15
532
33
20
16
29
1.95
102977195--102978323
147
7.8
142
79
14
959
33
20
16
29
1.95
102977471--102977649
92
2.0
90
84
4
234
34
18
18
27
1.95
102977550--102977706
79
2.0
79
83
2
199
32
21
17
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102977729--102978323
141
4.3
142
88
7
750
33
20
17
28
1.95
102977729--102978323
72
8.6
72
83
9
706
33
20
17
28
1.95
102986617--102986652
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
102988573--102988659
39
2.2
39
79
4
104
54
4
5
35
1.45
102988603--102988662
24
2.5
24
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15
61
60
6
3
30
1.39
102989151--102989210
18
3.4
18
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2
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3
5
15
76
1.08
102997961--102998449
132
3.7
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405
33
19
20
26
1.96
102997990--102998491
263
1.9
263
79
8
565
33
19
19
27
1.96
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0
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1.9
32
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0
1
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1.05
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1.9
21
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0
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5
2
35
1.34
103010569--103010618
21
2.4
21
86
6
66
48
2
2
48
1.24
103010570--103010618
22
2.2
23
82
10
66
46
2
2
48
1.25
103010957--103011003
18
2.5
19
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31
0
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1.27
103012817--103012928
55
2.0
55
100
0
224
42
17
23
16
1.88
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18
5.2
18
90
0
150
26
23
17
32
1.96
103013445--103013537
36
2.6
36
96
0
168
26
23
17
32
1.96
103020124--103020223
50
2.0
50
100
0
200
30
10
28
32
1.89
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17
2.2
17
87
12
55
75
4
4
14
1.14
103021094--103021134
18
2.2
19
91
8
66
75
4
4
14
1.14
103021102--103021146
18
2.3
18
85
11
54
73
2
8
15
1.18
103021251--103021385
10
13.1
11
68
13
58
62
2
3
31
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103021297--103021339
20
2.2
19
91
4
68
67
2
0
30
1.03
103021239--103021341
30
3.5
29
75
13
95
65
1
2
30
1.18
103021594--103021665
17
3.9
17
73
12
63
31
1
1
65
1.10
103021574--103021665
28
3.3
28
78
14
84
28
1
3
67
1.13
103021601--103021662
20
3.3
19
74
19
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1
1
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1.11
103027844--103027875
16
1.9
17
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57
59
3
6
31
1.38
103041652--103042163
205
2.5
205
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1.96
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5
0
58
1.27
103043996--103044066
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12
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2
1
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1.21
103044006--103044117
13
7.9
14
69
25
67
35
5
0
58
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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