Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  5  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1195761--1195792
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2
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2.3
24
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1.12
1197408--1197459
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1
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2.4
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29
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1.9
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1.9
24
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43
0
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50
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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3
0
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2
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1
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1243073--1243123
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2.1
21
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2.0
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3
1
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1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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0
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1
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1.20
1296677--1296757
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12
75
12
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1
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1.17
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22
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15
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2.1
27
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2.2
110
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4
324
22
19
16
41
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1372153--1372177
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0
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0
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10
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0
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0
0
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0.88
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19
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0
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1
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15
7
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1.77
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2.1
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10
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32
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16
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25
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18
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0
55
29
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9
60
1.28
1411865--1411923
26
2.2
26
82
11
66
25
0
8
66
1.20
1412648--1412713
29
2.3
29
84
5
80
51
7
10
30
1.64
1412938--1412988
26
1.9
27
92
4
86
52
0
1
45
1.12
1412939--1413001
26
2.4
26
86
5
83
55
1
1
41
1.19
1413075--1413132
25
2.3
26
84
3
73
32
1
1
63
1.14
1415044--1415096
27
1.9
26
85
11
70
52
7
3
35
1.48
1426200--1426302
38
2.7
38
75
3
109
22
22
21
33
1.97
1434401--1434431
13
2.4
13
94
0
53
58
3
12
25
1.50
1442246--1442285
6
6.8
6
85
5
55
2
12
2
82
0.87
1453354--1453415
29
2.1
30
88
8
92
25
3
11
59
1.46
1453966--1454033
30
2.2
30
94
2
118
39
1
14
44
1.55
1456382--1456407
7
3.7
7
100
0
52
15
0
0
84
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1456483--1456520
19
2.0
19
100
0
76
31
10
26
31
1.90
1457412--1457451
19
2.0
20
86
13
57
77
2
5
15
1.04
1465921--1465954
17
2.0
17
94
0
59
35
14
0
50
1.44
1466116--1466185
32
2.3
29
83
11
79
44
11
1
42
1.49
1467864--1467895
16
2.0
16
100
0
64
43
12
6
37
1.68
1468486--1468584
48
2.0
49
96
1
182
34
6
20
39
1.77
1471043--1471166
23
5.2
24
80
10
116
21
22
21
33
1.97
1471068--1471166
45
2.1
47
85
7
141
19
23
22
35
1.96
1471068--1471178
23
4.8
23
76
11
102
20
23
20
35
1.96
1471068--1471179
45
2.4
46
78
11
122
20
23
20
35
1.96
1488210--1488266
29
1.9
30
86
10
82
33
10
10
45
1.73
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21
1.9
21
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5
62
56
12
7
23
1.62
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13
3.0
14
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10
50
28
0
4
66
1.12
1492261--1492568
153
2.0
153
97
0
580
29
17
12
40
1.86
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2.0
15
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0
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43
0
0
56
0.99
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17
2.1
17
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0
61
45
0
0
54
0.99
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17
2.1
17
89
10
54
42
0
2
54
1.15
1501995--1502021
4
6.8
4
100
0
54
25
0
48
25
1.52
1502490--1502536
25
1.9
24
86
4
67
31
6
2
59
1.34
1502818--1502869
11
4.7
11
82
0
59
23
5
5
65
1.36
1503886--1503952
32
2.1
32
97
0
125
43
7
2
46
1.47
1511490--1511514
11
2.3
11
100
0
50
56
8
0
36
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1513276--1513514
123
1.9
123
81
3
284
30
21
12
35
1.90
1513410--1513665
137
1.9
137
79
6
295
32
19
11
36
1.88
1515003--1515027
6
4.2
6
100
0
50
80
0
0
20
0.72
1539943--1539993
22
2.2
24
86
6
70
58
5
0
35
1.22
1540048--1540095
21
2.3
20
79
6
60
29
2
6
62
1.31
1540178--1540220
20
2.2
20
86
0
59
23
4
2
69
1.18
1547007--1547036
15
1.9
16
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33
10
23
33
1.88
1558185--1558225
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2.0
21
90
0
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29
21
29
19
1.98
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16
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4
4
47
1.42
1568905--1568929
10
2.5
10
100
0
50
52
8
0
40
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333