Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
925309--925366
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3.1
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2.0
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2
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7
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35
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1.91
936200--936242
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2.0
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1
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959373--959418
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0
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30
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2.2
26
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2
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1
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2.0
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2.0
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0
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12
100
0
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15
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30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2.1
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100
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11
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137
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2
506
22
23
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40
1.89
1017029--1017394
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2.0
185
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23
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21
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22
22
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50
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26
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2.1
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28
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45
0
2
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0
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36
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2.0
42
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23
1
37
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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2
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22
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22
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63
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9
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1.13
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2.3
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72
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0
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0
100
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26
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0
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0
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43
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26
1.72
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2.3
40
100
0
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27
1.81
1126447--1126554
48
2.2
48
96
0
198
25
39
6
27
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1126503--1126570
32
2.1
32
94
0
118
26
33
10
29
1.89
1126423--1126578
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3.9
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12
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35
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28
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3.5
17
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38
2.1
39
97
2
155
30
17
11
40
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18
5.2
18
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0
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20
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0
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0
0
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2.0
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2
119
30
5
28
35
1.80
1142013--1142047
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
1141900--1142213
157
2.0
157
96
0
574
44
2
5
47
1.40
1142150--1142191
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
1142159--1142200
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
1142473--1142755
91
3.0
93
84
7
317
48
3
3
44
1.35
1142573--1142633
28
2.2
28
85
5
81
50
3
0
45
1.17
1142580--1142723
47
3.1
46
65
23
113
49
4
2
44
1.33
1142548--1142755
91
2.3
90
90
4
326
46
4
3
45
1.39
1142573--1142715
44
3.2
43
68
16
119
48
3
2
46
1.31
1142598--1142736
47
3.0
47
68
17
137
49
4
2
43
1.34
1147028--1147052
11
2.3
11
100
0
50
32
0
8
60
1.26
1148667--1148718
6
8.7
6
78
0
59
26
32
38
1
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1148667--1148736
12
5.8
12
76
6
61
24
31
41
2
1.69
1152301--1152345
20
2.2
20
88
7
65
2
28
0
68
1.01
1152912--1152961
19
2.5
20
81
15
59
68
0
0
32
0.90
1154980--1155018
17
2.3
17
95
0
69
30
12
5
51
1.62
1155971--1156003
17
1.9
17
88
11
50
42
0
0
57
0.98
1160200--1160258
28
2.1
28
87
0
82
44
5
18
32
1.72
1165988--1166071
26
3.2
26
91
3
132
29
9
26
34
1.88
1170418--1170457
19
2.1
19
100
0
80
30
25
15
30
1.95
1173914--1174242
129
2.6
128
87
2
453
35
20
16
27
1.94
1176130--1176187
26
2.2
26
93
0
98
34
5
24
36
1.78
1179577--1179627
25
2.1
23
82
7
57
13
0
11
74
1.07
1182194--1182230
15
2.5
15
95
0
65
37
0
45
16
1.47
1184533--1184580
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
1184529--1184584
24
2.3
24
81
6
69
66
1
1
30
1.12
1184529--1184580
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
1184732--1184796
25
2.8
24
83
6
80
52
6
7
33
1.55
1184812--1184888
23
3.3
22
75
13
73
55
2
3
37
1.32
1184817--1184954
46
3.1
43
74
20
122
56
2
3
36
1.32
1184738--1184934
23
8.7
23
69
19
67
54
4
5
35
1.44
1184813--1184934
14
9.1
14
66
18
57
54
3
3
38
1.33
1185221--1185253
16
2.1
16
100
0
66
36
33
6
24
1.80
1185455--1185518
30
2.1
30
94
0
110
23
3
48
25
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1186264--1186313
14
3.6
14
81
7
57
64
4
12
20
1.43
1186293--1186612
74
4.3
73
83
5
383
34
21
17
27
1.95
1186293--1186612
152
2.1
147
86
6
437
34
21
17
27
1.95
1186480--1186869
128
3.0
128
83
7
475
34
20
16
28
1.94
1186744--1187469
73
9.4
73
74
14
575
33
20
16
28
1.95
1186930--1186957
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
1187167--1187194
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
1186744--1187397
237
2.8
237
93
0
1094
33
21
16
28
1.95
1187182--1187469
145
2.0
147
86
3
411
33
21
17
28
1.96
1195765--1195819
12
5.0
12
72
20
57
41
7
25
25
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333