Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  242  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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79810593--79810715
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176
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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(0-2)
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2
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20
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
79880814--79880994
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45
93
0
161
32
24
9
32
1.88
79916561--79916629
29
2.3
30
78
14
79
68
2
8
20
1.30
79926183--79926251
29
2.3
30
78
14
79
68
2
8
20
1.30
79929564--79929600
19
1.9
19
94
0
65
62
0
5
32
1.18
79937388--79937547
27
5.9
27
77
12
141
35
21
22
21
1.96
79937406--79937547
54
2.6
54
87
3
196
35
22
22
19
1.96
79945378--79945505
27
4.7
27
82
6
152
34
21
24
20
1.97
79945350--79945508
54
3.0
53
87
8
218
34
19
24
21
1.96
79945739--79945771
18
1.9
17
88
11
50
12
36
18
33
1.88
79948025--79948161
63
2.2
64
82
6
172
18
27
26
27
1.98
79956143--79956260
37
3.0
39
79
19
145
26
27
22
23
2.00
79971249--79971294
24
1.9
24
81
0
56
34
21
0
43
1.53
79977786--79977810
13
1.9
13
100
0
50
48
0
8
44
1.32
79978240--79978281
21
2.0
21
86
9
59
38
0
2
59
1.10
79978250--79978397
73
2.0
74
90
1
235
36
5
5
52
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79978712--79978743
6
5.5
6
96
3
57
53
0
0
46
1.00
79984693--79984864
93
1.8
93
92
0
290
29
30
20
20
1.97
79984686--79984860
46
3.8
46
78
13
196
29
30
20
20
1.97
79989328--79989358
15
2.1
15
93
0
53
58
6
6
29
1.48
79989594--79989640
24
2.1
22
75
20
53
61
4
8
25
1.43
79989625--79989674
26
1.9
26
87
0
73
56
2
2
40
1.22
79999123--79999165
19
2.4
17
82
17
52
51
0
23
25
1.49
80001028--80001086
20
2.7
21
74
12
57
37
13
1
47
1.53
80001262--80001438
45
4.0
45
81
7
204
32
27
17
22
1.96
80001262--80001425
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1.9
90
82
10
214
30
27
18
23
1.98
80001981--80002011
15
2.1
15
93
0
53
54
25
0
19
1.44
80002527--80002555
14
2.0
15
93
6
51
51
20
0
27
1.47
80007031--80007063
12
2.7
13
90
9
52
57
3
0
39
1.14
80007031--80007068
14
2.7
14
87
0
58
55
5
0
39
1.23
80015002--80015079
26
3.1
25
74
3
68
42
16
19
21
1.89
80016473--80016785
46
6.6
47
78
11
222
24
27
19
28
1.99
80016521--80016793
94
2.9
93
77
13
283
24
28
19
27
1.98
80016522--80016785
140
1.9
142
83
7
351
24
28
19
28
1.98
80018677--80018799
55
2.2
56
88
2
176
26
12
28
33
1.92
80018677--80018799
28
4.4
28
90
2
176
26
12
28
33
1.92
80018702--80018812
28
4.0
27
90
3
116
28
11
26
33
1.91
80025432--80025510
37
2.1
37
88
0
113
26
31
17
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80025629--80025753
49
2.6
49
80
2
155
27
31
8
32
1.87
80026747--80026771
13
1.9
13
100
0
50
32
16
20
32
1.94
80028305--80028418
39
2.9
40
82
2
149
24
28
23
22
1.99
80028349--80028498
40
3.7
40
77
9
121
24
26
24
26
2.00
80028304--80028501
79
2.5
81
78
12
205
24
28
22
24
2.00
80039871--80040036
27
6.2
26
84
6
197
36
23
23
16
1.95
80039871--80040036
54
3.1
54
91
1
253
36
23
23
16
1.95
80039871--80040036
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2.0
81
85
4
219
36
23
23
16
1.95
80047737--80047877
27
5.2
26
83
10
176
34
21
24
19
1.96
80047721--80047880
54
3.0
54
90
3
245
34
19
25
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333