Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  52  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15057366--15057511
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25
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15063398--15063495
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2.3
19
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0
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20
20
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40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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0
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2.1
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0
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23
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18
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17
21
31
1.96
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4.7
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3
211
29
14
20
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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22
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202
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21
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17
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23
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1.96
15182873--15183010
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2.1
17
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74
0
22
2
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15196129--15196167
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2.0
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52
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17
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23
2.0
23
83
8
58
41
10
15
32
1.82
15221861--15221885
13
1.9
13
100
0
50
52
16
8
24
1.70
15222936--15223044
54
2.0
54
100
0
218
33
5
29
31
1.80
15223886--15223928
22
2.0
22
81
9
52
13
4
11
69
1.33
15224962--15225015
26
2.1
26
100
0
108
40
7
25
25
1.82
15225497--15225528
10
3.3
10
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4
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43
0
0
56
0.99
15225495--15225549
9
6.1
9
73
23
53
47
0
0
52
1.00
15225449--15225549
36
2.9
36
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8
109
48
2
0
47
1.23
15225510--15225564
26
2.1
27
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10
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0
0
56
0.99
15226069--15226110
18
2.3
18
100
0
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0
35
38
1.57
15227338--15227378
12
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12
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58
0
17
24
1.38
15234000--15234044
21
2.2
21
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7
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22
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1.95
15242158--15242344
50
3.8
50
76
9
179
21
29
17
30
1.97
15242161--15242336
96
1.8
96
85
2
246
22
29
17
30
1.96
15242670--15242732
29
2.2
29
77
13
67
33
30
11
25
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15247815--15248075
40
6.5
39
84
4
292
26
26
20
26
1.99
15247815--15248075
80
3.3
80
86
4
341
26
26
20
26
1.99
15263107--15263284
27
6.6
27
81
3
187
26
16
27
29
1.97
15263108--15263263
82
1.9
81
85
3
215
26
16
27
28
1.97
15263104--15263284
82
2.2
81
81
2
211
27
16
27
29
1.97
15267134--15267219
25
3.5
25
77
1
93
31
17
22
29
1.96
15271524--15271622
41
2.4
41
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0
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35
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24
23
1.95
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10
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30
1.97
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2.0
20
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0
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1.23
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17
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2
4
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1.22
15282147--15282215
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7
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1
2
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1.13
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0
150
30
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1.94
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2.0
16
100
0
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50
12
6
31
1.65
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12
2.2
12
100
0
52
53
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15
15
1.73
15293357--15293621
40
6.7
40
84
6
324
26
26
21
26
2.00
15301384--15301643
40
6.6
40
84
7
325
26
26
20
26
1.99
15301384--15301643
79
3.3
80
86
5
350
26
26
20
26
1.99
15301351--15301643
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2.5
119
80
8
312
25
26
20
27
1.99
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7.5
50
76
10
266
26
28
18
26
1.98
15306644--15307025
146
2.6
146
80
5
367
25
28
18
26
1.98
15308829--15308871
2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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23
2.4
23
100
0
110
16
25
27
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15318313--15318379
31
2.2
32
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10
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35
4
0
59
1.18
15318708--15318754
24
2.0
22
84
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40
0
2
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1.11
15324607--15324640
14
2.4
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0
5
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1.20
15324621--15324667
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2.3
22
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14
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61
0
4
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15325349--15325393
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1.35
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0
0
50
1.00
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0
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1
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15338441--15338602
59
2.7
59
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1
209
35
6
8
50
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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