Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  31  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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134
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7
7
30
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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222
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578
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2024
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16
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2
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19
21
26
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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19
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3.9
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118
40
18
9
30
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8893247--8893305
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41
2.0
41
92
4
139
45
4
21
28
1.73
8915865--8915943
25
3.2
23
72
21
61
46
3
2
46
1.34
8918280--8918309
10
3.0
10
90
0
51
16
10
10
63
1.51
8924300--8924644
3
113.0
3
70
12
148
61
3
6
28
1.39
8924497--8924633
25
5.8
24
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17
79
59
3
7
29
1.41
8924602--8924672
25
2.7
27
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10
85
66
0
4
29
1.11
8924602--8924672
13
5.5
13
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15
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66
0
4
29
1.11
8941764--8941790
13
2.1
13
100
0
54
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37
14
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2.0
17
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50
36
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1.39
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15
2.5
16
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16
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66
5
5
23
1.32
8947885--8948175
3
97.0
3
72
14
120
59
2
8
30
1.39
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20
2.5
20
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6
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2
2
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1.20
8948456--8948484
14
2.1
14
100
0
58
41
24
6
27
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8949479--8949543
20
3.1
20
80
13
69
41
0
4
53
1.21
8959216--8959389
3
57.7
3
69
10
95
59
2
8
30
1.39
8959550--8959591
20
2.1
20
86
0
57
61
2
4
30
1.29
8959549--8959588
14
3.2
13
83
16
57
62
2
5
30
1.29
8959553--8959684
3
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3
70
8
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1
9
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1.39
8962902--8963030
58
2.2
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174
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5
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50
1.54
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3.1
127
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2
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28
15
20
35
1.93
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2.1
72
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15
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2.0
17
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0
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0
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2.0
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3
0
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1.03
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21
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1
0
20
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0
0
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2.8
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0
0
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23
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26
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35
0
23
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25
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20
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30
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25
1.9
24
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8
76
34
2
0
63
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8998469--8998527
25
2.3
26
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5
1
55
1.32
8998478--8998595
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4.3
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3.3
21
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5
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0
0
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0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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