Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  7  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1711499--1711544
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25
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0
1
57
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1850617--1850667
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16
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0
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18
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28
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2
74
50
14
11
23
1.74
1884737--1884768
13
2.4
14
85
15
50
62
6
6
25
1.42
1884755--1884790
17
2.1
18
89
5
56
52
2
2
41
1.30
1885581--1885801
107
2.1
107
85
2
293
37
12
18
31
1.88
1907979--1908012
12
2.7
13
90
4
52
44
47
0
8
1.34
1907975--1908019
13
3.5
13
81
6
56
40
46
0
13
1.43
1908491--1908604
15
7.9
14
72
17
65
27
8
0
63
1.30
1908520--1908604
44
1.9
44
84
13
113
28
9
0
62
1.26
1908479--1908598
29
4.1
29
69
16
88
27
7
1
63
1.31
1908675--1908702
6
4.7
6
100
0
56
17
0
0
82
0.68
1908713--1908805
24
3.9
23
68
13
62
30
7
3
59
1.41
1908713--1908840
25
5.2
24
68
13
80
30
7
3
58
1.43
1910697--1910748
15
3.2
15
73
19
50
44
0
1
53
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1910811--1910866
22
2.6
22
83
5
62
51
0
0
48
1.00
1914442--1914502
31
1.9
32
90
3
97
37
4
8
49
1.54
1920737--1920768
15
2.1
15
94
0
55
31
3
12
53
1.54
1922017--1922067
19
2.9
17
83
11
66
35
17
9
37
1.83
1923745--1923791
22
2.1
22
100
0
94
17
36
23
23
1.95
1929639--1929682
19
2.3
20
84
7
56
27
20
11
40
1.86
1932188--1932251
17
3.4
19
75
16
62
75
6
6
12
1.19
1932190--1932234
20
2.2
20
88
4
63
80
4
4
11
1.01
1933183--1933212
15
1.9
16
93
6
53
76
0
10
13
1.01
1934445--1935005
88
6.4
88
90
2
735
28
22
23
25
1.99
1935240--1935389
44
3.4
45
70
9
121
30
18
24
28
1.97
1935236--1935397
87
1.9
87
87
5
238
30
18
24
27
1.98
1936943--1936992
3
16.7
3
82
15
59
26
2
2
70
1.09
1939352--1939402
19
2.9
17
83
11
66
37
17
7
37
1.79
1941100--1941186
43
2.0
43
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0
120
22
22
0
54
1.46
1941120--1941158
15
2.6
14
80
11
51
23
23
0
53
1.46
1969101--1969151
22
2.2
24
79
10
61
43
0
13
43
1.44
1969283--1969395
47
2.4
47
83
0
154
30
11
21
36
1.89
1987004--1987057
5
11.0
5
77
18
60
77
1
0
20
0.86
1986998--1987054
19
2.9
19
77
12
62
75
1
0
22
0.90
1987003--1987049
24
2.0
24
87
8
69
76
2
0
21
0.89
1992253--1992324
3
23.7
3
74
13
58
29
4
1
65
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1992476--1992517
3
14.0
3
100
0
84
33
0
0
66
0.92
1992718--1992754
3
12.3
3
100
0
74
32
0
0
67
0.91
1992899--1992943
9
5.1
9
87
12
51
26
0
0
73
0.84
1992894--1992945
17
3.2
18
82
15
60
26
1
0
71
0.97
1992892--1992942
13
3.8
13
78
21
61
27
1
0
70
0.98
1996711--1996785
37
2.0
37
94
0
132
34
16
18
30
1.93
2006618--2006707
18
5.0
18
86
0
126
31
16
24
27
1.97
2006619--2006707
36
2.5
36
92
0
142
31
16
23
28
1.96
2011687--2011824
54
2.6
54
87
2
170
36
21
23
18
1.94
2011687--2011826
27
5.2
26
87
4
154
37
22
22
17
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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