Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  290  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95780652--95780696
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3.4
13
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63
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6
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1.31
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410
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1.90
95780665--95780840
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87
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17
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1.94
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3.2
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0
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0
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2.0
76
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0
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21
20
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2.7
128
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22
20
20
1.95
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36
22
21
19
1.95
95806676--95806731
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2.3
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2
178
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23
14
40
1.90
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2.0
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4.4
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86
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21
18
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1.8
172
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15
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0
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0
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21
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40
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22
116
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21
18
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18
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125
3.2
125
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7
290
29
14
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5
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5
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5
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3
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40
0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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24
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95826663--95826709
24
2.0
24
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62
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2
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51
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2.0
16
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0
9
0
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95840725--95840839
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29
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2.6
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22
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1.92
95844003--95844136
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3.0
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4
153
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1.93
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2.9
37
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20
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1.98
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19.3
48
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1398
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6
35
1.83
95848059--95849009
98
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96
89
4
1398
31
26
6
35
1.83
95848059--95849009
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6.4
146
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3
1514
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26
6
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3.2
13
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2
0
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2
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4
44
1.73
95874671--95874781
44
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4
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31
20
20
27
1.98
95874686--95874779
45
2.1
44
84
5
118
30
19
22
27
1.98
95874853--95875025
44
3.9
44
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1
186
30
18
21
28
1.97
95874853--95875116
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91
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275
30
18
22
28
1.97
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233
1.9
233
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662
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19
19
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2.3
44
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25
27
1.98
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12
2.9
12
95
0
61
31
5
0
62
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95878355--95878516
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53
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2
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32
17
16
33
1.92
95878361--95878572
53
4.0
51
75
6
138
33
17
17
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1.94
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15
3.0
15
90
0
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2
11
28
1.45
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2.8
45
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12
146
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17
25
30
1.97
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5.6
40
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247
25
25
24
24
2.00
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2.2
26
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15
22
24
37
1.93
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114
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27
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2.1
25
100
0
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95906974--95907019
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2.3
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7
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12
0
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1.28
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22
2.5
22
80
11
60
25
12
0
61
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95925293--95925389
18
5.2
18
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3
64
1.39
95925414--95925484
27
2.6
27
93
2
115
36
16
0
46
1.48
95925414--95925501
28
3.2
28
85
4
108
35
15
0
48
1.46
95925579--95925613
16
2.1
17
94
5
63
22
11
0
65
1.24
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1.9
24
82
4
58
23
6
2
68
1.24
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16
1.9
16
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25
15
0
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1.36
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50
2.5
47
83
8
132
21
12
0
64
1.32
95925930--95926021
24
3.8
23
71
22
71
21
10
1
66
1.29
95925996--95926036
21
2.0
21
90
0
64
21
12
2
63
1.40
95925924--95926035
50
2.2
50
84
6
147
23
13
0
62
1.36
95925996--95926043
21
2.2
21
85
3
60
22
10
2
64
1.35
95929433--95929676
110
2.2
111
88
5
357
33
20
20
25
1.97
95930725--95930780
29
2.0
28
86
10
80
37
8
7
46
1.63
95932428--95932462
17
2.1
17
94
0
61
25
8
5
60
1.49
95934317--95934362
23
2.0
24
86
4
67
43
0
2
54
1.12
95934411--95934458
18
2.7
18
83
0
60
70
2
4
22
1.15
95934566--95934632
19
3.6
19
78
9
68
61
1
0
37
1.05
95934339--95934708
180
2.1
180
90
2
575
52
4
2
39
1.38
95934868--95934938
22
3.3
23
76
9
78
35
2
0
61
1.10
95934876--95934936
23
2.7
23
84
5
70
36
3
0
60
1.13
95935501--95935588
14
5.0
17
67
22
65
67
1
25
6
1.22
95936737--95936786
16
3.1
17
80
8
59
42
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95937675--95937776
51
2.0
51
88
0
150
42
12
18
26
1.86
95938360--95938406
23
2.0
23
88
8
69
12
8
38
40
1.74
95939585--95939640
12
4.8
12
78
22
66
58
0
32
8
1.29
95939582--95939640
23
2.6
23
97
0
109
59
0
32
8
1.28
95939761--95939829
30
2.3
31
85
7
88
24
8
18
47
1.77
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45
3.9
45
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0
240
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15
19
25
1.91
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2.0
86
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3
284
32
9
12
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1.75
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19
3.2
19
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3
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1.38
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2.1
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109
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52
1.46
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2.5
21
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3
70
48
1
1
48
1.24
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44
2.0
44
88
0
129
45
4
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41
1.54
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19
2.1
19
86
9
55
42
10
2
45
1.51
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29
1.9
29
92
3
94
38
12
5
43
1.66
95981114--95981143
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2.0
15
93
0
51
16
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6
13
1.50
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4.7
51
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11
280
20
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41
1.89
95995066--95995292
96
2.4
96
91
0
355
20
24
14
41
1.89
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17
2.0
17
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5
59
0
36
0
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0.95
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16
2.8
17
83
6
58
13
13
0
73
1.09
95997443--95997480
10
3.7
10
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13
51
5
15
0
78
0.91
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3.1
47
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16
120
44
1
5
48
1.34
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2.3
91
91
0
324
45
2
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46
1.40
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28
2.2
28
85
5
81
45
0
3
50
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96000717--96000859
44
3.2
43
68
16
119
46
1
4
47
1.32
96000889--96001101
56
3.6
57
69
20
152
40
3
4
51
1.39
96001038--96001078
15
2.8
15
82
10
50
43
0
2
53
1.13
96000900--96001199
122
2.5
121
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489
42
2
5
49
1.40
96001143--96001177
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2.0
17
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0
0
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0.99
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0
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0
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0
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4
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1.37
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0
0
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4.2
12
80
9
50
31
7
0
60
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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