Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  43  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12211695--12211772
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0
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0
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0
0
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0.98
12215576--12215646
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2.3
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1
0
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1.07
12215753--12215801
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2.1
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82
10
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12217484--12217624
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2.7
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2.0
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2.2
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20
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2.0
21
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9
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4
0
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19
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21
3.0
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5
5
33
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4.5
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3
3
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2.1
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18
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1
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20
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1.9
30
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0
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24
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37
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.97
12252355--12252412
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1.9
30
82
0
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1.85
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2.0
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100
0
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1.83
12261863--12261891
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100
0
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10
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2.2
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30
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12329988--12330165
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3.3
54
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7
164
30
28
15
25
1.96
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33
2.4
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13
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1.9
102
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5
248
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22
15
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157
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17
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25
1.97
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2.7
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170
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29
26
1.97
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2.0
41
92
0
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2.3
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22
16
33
1.95
12341767--12341955
105
1.8
105
82
4
247
28
23
14
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
1
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2.1
27
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1
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24
1.59
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2.4
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4
0
55
1.21
12359717--12359758
13
2.9
14
80
13
50
52
0
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1.13
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1.93
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1.94
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20
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1.95
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2.1
17
100
0
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28
22
25
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12415456--12415482
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
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2.6
50
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138
31
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27
24
1.97
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1.97
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29
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30
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1.98
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46
77
13
187
29
29
20
21
1.98
12425658--12425828
93
1.8
93
92
0
288
29
29
20
21
1.98
12430274--12430307
17
2.0
17
94
0
59
50
23
14
11
1.76
12430623--12430664
22
1.9
22
100
0
84
45
11
23
19
1.83
12431858--12431938
30
2.7
30
96
0
144
38
6
22
33
1.79
12432241--12432294
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
12432543--12432786
49
4.9
49
83
2
281
25
18
26
29
1.98
12436522--12436641
46
2.6
48
85
6
158
29
21
25
24
1.99
12436753--12436878
49
2.6
50
78
6
141
30
20
26
22
1.98
12443640--12443673
16
2.1
16
89
10
52
29
5
32
32
1.81
12452390--12452426
12
2.9
13
88
11
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5
2
10
0.96
12458178--12458252
30
2.5
30
89
6
118
44
2
25
28
1.68
12459703--12459743
12
3.4
12
96
0
73
19
26
31
21
1.97
12464106--12464143
13
2.9
13
85
11
51
55
21
0
23
1.44
12465843--12465973
51
2.6
49
85
4
174
26
27
20
25
1.99
12467852--12467952
42
2.4
43
85
5
125
30
24
18
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12475157--12475211
27
2.1
27
82
3
67
32
16
23
27
1.96
12477325--12477403
39
2.0
39
97
0
149
22
24
29
24
1.99
12480625--12480686
27
2.3
27
94
0
115
20
20
19
38
1.93
12480640--12480699
27
2.2
27
84
0
75
21
23
16
38
1.93
12482234--12482276
19
2.2
20
88
8
63
53
4
6
34
1.49
12482356--12482401
22
2.1
22
100
0
92
69
4
8
17
1.31
12482416--12482447
17
1.9
16
93
6
55
78
0
21
0
0.76
12487344--12487473
49
2.6
49
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7
174
26
16
31
26
1.96
12490353--12490386
16
2.1
16
100
0
68
17
11
26
44
1.83
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2.4
53
79
7
134
26
32
24
16
1.96
12500884--12500919
16
2.2
16
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0
63
50
0
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1.48
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25
2.3
26
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14
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62
1
12
24
1.39
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46
4.0
46
90
1
240
21
24
14
39
1.90
12514208--12514247
20
2.0
20
90
9
64
0
25
0
75
0.81
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29
2.1
30
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3
90
1
17
4
75
1.05
12516755--12516923
46
3.7
44
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15
173
27
18
29
24
1.98
12516939--12517068
49
2.6
49
83
6
147
27
19
30
23
1.98
12525726--12525767
9
4.8
9
79
5
50
73
7
16
2
1.15
12529953--12530013
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
12533032--12533077
20
2.3
20
92
0
74
41
8
8
41
1.67
12533034--12533082
20
2.6
19
83
6
55
36
8
10
44
1.68
12533321--12533472
56
2.7
55
89
4
232
35
25
13
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12535069--12535142
19
3.9
19
75
10
71
37
6
14
40
1.73
12535068--12535142
38
1.9
39
83
2
98
37
6
16
40
1.74
12537571--12537644
23
3.2
25
78
16
79
60
0
6
32
1.23
12537606--12537638
16
2.0
17
88
5
50
60
0
6
33
1.21
12540040--12540064
12
2.1
12
100
0
50
24
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32
28
1.96
12542236--12542262
11
2.5
11
100
0
54
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7
14
29
1.71
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18
2.4
18
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0
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2
0
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17
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2
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27
1.27
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18
5.7
19
67
20
52
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2
2
32
1.24
12542871--12542990
20
6.3
19
70
18
79
62
2
3
31
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333