Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  19  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5590134--5590225
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45
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3
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0
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26
0
0
73
0.84
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2.6
26
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4
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1
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25
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2.4
60
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10
145
24
26
12
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
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1.9
40
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0
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17
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19
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17
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19
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1
11
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5670454--5670504
18
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19
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19
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1.10
5670466--5670506
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2.0
21
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5673738--5673776
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0
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26
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2.0
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1.00
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2
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16
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0
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0
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3.9
37
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5.6
46
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10
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28
22
14
34
1.93
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4.3
52
85
8
299
27
22
14
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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98
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1
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1
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114
100
0
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2.4
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1
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1
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32
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0
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2.0
35
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0
97
29
23
9
36
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5821694--5821800
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2.2
48
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17
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1.96
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35
2.0
35
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11
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1.89
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19
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4
0
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2.3
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58
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2
0
45
1.14
5843892--5843948
26
2.3
23
76
21
62
47
5
0
47
1.24
5844014--5844061
13
3.4
14
77
11
53
54
0
0
45
0.99
5844042--5844100
23
2.6
22
81
10
66
50
6
0
42
1.28
5846994--5847031
19
2.0
19
94
0
67
34
10
23
31
1.89
5847905--5847944
19
2.0
20
86
13
57
77
2
5
15
1.04
5848187--5848232
18
2.7
17
86
6
58
8
6
0
84
0.77
5854037--5854074
9
4.2
9
89
0
58
47
0
0
52
1.00
5866745--5866854
26
4.2
26
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0
157
35
5
22
36
1.78
5868340--5868392
26
2.0
26
85
7
72
37
18
15
28
1.91
5870201--5870262
30
2.1
30
93
0
106
29
1
11
58
1.42
5870635--5870692
26
2.3
25
81
3
71
44
1
0
53
1.10
5879647--5879697
26
2.0
26
85
11
70
64
1
0
33
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5880011--5880058
19
2.5
20
93
6
89
54
4
25
16
1.60
5882447--5882587
50
2.8
49
78
4
149
30
28
19
21
1.98
5884157--5884233
38
2.0
38
100
0
154
40
18
5
36
1.73
5887085--5887109
11
2.3
11
100
0
50
24
0
0
76
0.80
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21
1.9
22
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5
57
36
2
4
56
1.34
5894504--5894597
37
2.6
35
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14
120
32
0
2
64
1.05
5894375--5894659
10
31.0
9
66
19
101
32
2
3
61
1.25
5894499--5894587
46
1.9
47
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8
112
30
0
2
67
1.03
5894502--5894619
8
13.2
8
69
24
60
33
0
2
63
1.14
5894548--5894669
42
3.0
40
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12
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32
1
3
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1.21
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21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
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20
2.3
21
82
14
62
19
4
2
73
1.10
5904808--5904853
19
2.4
19
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10
67
19
4
2
73
1.10
5905006--5905030
12
2.1
12
100
0
50
32
16
0
52
1.44
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2.0
13
100
0
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7
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1.61
5910578--5910812
33
7.2
33
74
7
201
34
11
21
32
1.89
5910570--5910847
65
4.2
65
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3
398
33
12
21
32
1.91
5910594--5910837
33
7.5
33
72
9
167
33
11
21
33
1.90
5922376--5922402
7
3.9
7
100
0
54
25
0
0
74
0.83
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41
2.0
41
100
0
166
20
12
31
36
1.89
5931847--5931885
10
4.2
9
81
18
53
87
2
0
10
0.65
5931845--5931882
11
3.5
11
85
3
51
89
2
0
7
0.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5931845--5931881
19
1.9
19
94
0
65
89
2
0
8
0.58
5932993--5933038
14
3.3
14
75
0
56
47
0
15
36
1.45
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28
2.0
28
96
0
105
45
0
14
40
1.44
5933510--5933536
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2.1
13
100
0
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44
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18
1.86
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7
3.6
7
100
0
50
88
0
0
12
0.53
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1.9
21
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10
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25
25
25
25
2.00
5935413--5935459
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3
100
0
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0
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0
0.90
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16
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2
1.26
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100
0
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66
0
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1.20
5944431--5944480
10
5.0
10
86
13
68
70
2
8
20
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333