Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  308  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101013416--101013464
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1
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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22
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68
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22
1.18
101108918--101108975
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24
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2.1
23
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2
4
47
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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17
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0
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2.0
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2.0
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31
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.89
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15
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2.8
42
86
6
164
28
26
13
31
1.94
101190635--101190783
31
4.8
31
93
0
235
28
26
18
27
1.98
101196618--101196665
9
5.4
9
87
5
71
12
8
0
79
0.94
101196681--101196754
36
2.0
36
85
12
98
22
5
2
68
1.23
101196708--101196755
18
2.7
17
81
9
60
29
4
0
66
1.10
101196852--101196923
37
1.9
37
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101
43
1
4
51
1.29
101197594--101197641
10
5.0
9
80
12
51
54
4
0
41
1.20
101197584--101197641
29
2.0
28
93
3
98
55
3
0
41
1.17
101197667--101197703
19
1.9
19
89
10
58
62
2
0
35
1.10
101201204--101201296
30
3.1
30
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6
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30
26
18
24
1.98
101204144--101204203
27
2.2
28
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46
0
0
53
1.00
101204151--101204198
16
2.8
18
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0
0
60
0.97
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0
40
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4.0
11
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0
0
51
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101204713--101204761
18
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0
0
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0.96
101204691--101204764
28
2.7
27
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10
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43
0
0
56
0.99
101204936--101204975
12
3.2
12
85
3
53
52
5
0
42
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101205023--101205082
23
2.7
23
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10
63
56
1
0
41
1.09
101205099--101205172
37
2.0
37
85
12
100
68
2
5
22
1.23
101205094--101205145
18
2.9
18
80
5
61
67
0
3
28
1.08
101205153--101205190
18
2.2
18
90
4
60
73
2
13
10
1.19
101205150--101205212
18
3.3
18
75
14
56
77
1
9
11
1.05
101214729--101214790
19
3.2
20
74
14
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58
3
1
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3
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0
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34
0
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101223075--101223153
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10
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1.74
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3.5
20
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14
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49
14
11
25
1.76
101223069--101223155
42
2.1
42
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0
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11
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28
1.69
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7
76
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1.79
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18
3.2
18
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0
78
33
15
22
28
1.95
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29
2.0
29
90
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11
0
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101246053--101246083
7
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7
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4
55
61
0
9
29
1.28
101246052--101246096
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0
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1.23
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2.2
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1
0
40
1.09
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3.0
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6
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27
15
25
31
1.96
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14
2.2
14
94
0
53
77
3
6
12
1.08
101263990--101264018
6
5.0
6
91
8
51
82
0
17
0
0.66
101263985--101264018
11
3.0
11
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0
20
0
0.73
101271310--101271337
14
2.0
14
100
0
56
14
14
14
57
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101272179--101272208
7
4.1
7
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4
51
13
0
0
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0.57
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10
4.5
10
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16
56
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9
0
11
0.93
101274017--101274048
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3.0
11
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4
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81
9
0
9
0.88
101280787--101280830
18
2.4
19
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3
54
77
2
2
18
0.98
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1.9
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1.9
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378
32
15
24
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101283847--101283896
22
2.5
20
81
15
59
78
14
0
8
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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