Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  248  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81615757--81615803
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2.0
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266
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22
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221
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21
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26
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81662320--81662545
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1.9
120
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22
26
2.00
81662320--81662545
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29
28
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28
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1.96
81687346--81687392
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2.6
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21
0
72
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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81689021--81689077
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2.0
21
95
0
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16
11
14
57
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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50
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508
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1.82
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0
57
19
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21
57
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81831012--81831147
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3.3
15
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1.79
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234
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0
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0
33
1.58
81835253--81835289
3
12.3
3
100
0
74
0
32
0
67
0.91
81842586--81842663
31
2.6
30
78
9
79
35
8
14
41
1.77
81845193--81845242
15
3.4
16
73
18
54
64
2
6
28
1.28
81846480--81847103
133
4.7
133
89
1
836
27
22
20
30
1.98
81846615--81846959
43
7.8
44
69
14
185
26
22
21
29
1.99
81858980--81859029
15
3.4
16
73
18
54
64
2
6
28
1.28
81863415--81863439
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
81865523--81865580
26
2.2
27
96
3
109
48
15
12
24
1.79
81865446--81865681
132
1.8
129
95
4
429
37
12
16
33
1.86
81865997--81866052
27
2.0
28
89
3
87
46
12
5
35
1.65
81866408--81866437
11
2.7
11
89
0
51
23
0
3
73
0.98
81866553--81866593
17
2.5
16
85
14
57
34
0
4
60
1.18
81896229--81896278
25
2.0
25
100
0
100
40
12
12
36
1.79
81900759--81900895
23
5.8
24
75
8
102
17
24
18
39
1.92
81915593--81915843
48
5.2
48
95
0
439
35
5
27
31
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81925551--81925588
20
1.9
20
94
0
67
47
5
10
36
1.61
81925550--81925594
20
2.2
20
84
0
63
48
4
11
35
1.59
81927599--81927731
40
3.3
40
68
4
106
27
21
20
30
1.98
81927790--81927898
40
2.8
39
87
8
152
35
20
15
28
1.93
81928405--81928441
12
3.2
12
88
7
51
43
0
10
45
1.39
81929907--81930041
50
2.7
50
80
1
153
28
28
17
25
1.98
81931696--81931730
3
11.7
3
100
0
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0
0
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0.90
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2.1
22
100
0
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21
43
1.86
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23
2.2
23
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0
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14
18
32
1.90
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21
0
31
1.57
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39
2.0
39
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0
147
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21
0
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1.52
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2.0
57
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0
172
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23
0
30
1.58
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46
3.8
46
76
7
207
28
27
21
22
1.99
81957718--81957888
93
1.8
93
92
0
288
28
28
21
22
1.99
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30
3.0
30
77
8
92
57
14
16
11
1.65
81960272--81960351
15
5.4
15
77
7
83
58
12
17
11
1.62
81960283--81960360
15
5.2
15
74
9
61
56
14
16
12
1.68
81963282--81963451
93
1.8
93
92
0
286
28
27
21
22
1.99
81963273--81963448
46
3.8
46
73
15
173
28
27
21
21
1.99
81963281--81963467
46
4.0
45
70
18
125
28
27
21
22
1.99
81973500--81973550
25
2.1
24
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75
37
19
23
19
1.94
81980897--81980963
26
2.6
26
82
0
89
28
17
28
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81989661--81989723
28
2.2
28
97
0
117
22
36
23
17
1.95
82002438--82002612
46
3.8
46
76
13
187
30
29
19
20
1.97
82002445--82002616
93
1.8
93
92
2
292
29
29
19
20
1.97
82004289--82004356
27
2.5
28
83
11
95
33
29
10
26
1.89
82004287--82004384
28
3.5
28
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2
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1.92
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27
3.4
28
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127
26
11
28
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1.92
82009578--82009661
27
3.0
27
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5
96
29
11
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3.4
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2
129
26
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1.93
82017555--82017638
27
3.0
27
87
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96
29
11
25
33
1.91
82020557--82020593
19
1.9
19
89
10
58
51
0
10
37
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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