Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  81  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24935279--24935400
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24936927--24936980
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2.5
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0
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1.93
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5
5
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2.1
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93
0
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1.89
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2.1
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23
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24
14
1.91
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1
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38
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23
20
1.93
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2.3
30
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17
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1.65
24958216--24958278
15
4.2
15
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15
17
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1.68
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21
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2.3
30
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2
95
56
17
17
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1.65
24963696--24963758
15
4.2
15
74
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15
17
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93
1.8
93
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2
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19
22
1.98
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3.1
46
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115
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28
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22
1.98
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4.2
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16
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1.91
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2.0
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2.0
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17
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3.8
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2.0
42
82
8
102
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2.5
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0
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16
24
1.96
24992420--24992522
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2.8
37
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2
109
27
28
17
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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0
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1.84
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2.0
30
83
0
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31
22
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1.84
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2.0
20
100
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15
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1.96
25014413--25014752
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2.7
129
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2.0
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100
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2.1
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5.0
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1.84
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12.2
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22
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2.0
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83
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21
20
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19.7
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19
19
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3.5
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107
19
19
13
47
1.82
25025793--25025913
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3.4
37
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137
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19
13
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2.3
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0
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2.0
20
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50
30
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1.49
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21
2.0
20
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53
47
27
0
25
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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2.2
21
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21
1.97
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201
23
22
29
24
1.99
25077548--25077728
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2.3
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219
23
22
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1.99
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2.5
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4
50
26
0
2
70
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25112285--25112379
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39
14
13
33
1.84
25128619--25128768
41
3.7
41
83
1
212
30
28
21
20
1.98
25134979--25135049
28
2.5
28
90
0
115
23
14
32
29
1.94
25153999--25154057
26
2.3
26
91
2
93
37
0
6
55
1.26
25155604--25155660
10
5.3
11
81
8
55
59
0
0
40
0.97
25155602--25155660
21
2.8
21
75
12
66
57
0
0
42
0.98
25155604--25155659
11
5.3
10
81
10
51
58
0
0
41
0.98
25155627--25155699
35
2.1
36
89
2
112
53
0
0
46
1.00
25170925--25171070
37
3.9
37
90
0
220
25
32
19
22
1.97
25171273--25171560
47
6.1
47
89
0
432
26
29
11
32
1.91
25171273--25171561
141
2.0
141
93
0
488
26
29
11
32
1.91
25176788--25177042
39
6.5
39
92
1
404
29
29
22
18
1.98
25176788--25177075
78
3.7
78
89
3
413
27
29
23
19
1.98
25183202--25183406
39
5.3
39
89
1
279
30
27
21
19
1.98
25184544--25184648
37
2.8
37
92
0
174
27
31
17
23
1.97
25184906--25184996
46
2.2
38
70
26
92
25
29
13
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25184859--25185050
47
4.1
47
90
1
287
27
29
10
32
1.91
25184867--25185050
93
2.0
93
90
0
287
26
29
11
32
1.91
25189072--25189499
40
10.8
40
92
1
693
25
28
21
24
1.99
25189072--25189499
119
3.6
119
92
1
691
25
28
21
24
1.99
25189072--25189499
159
2.7
160
93
2
722
25
28
21
24
1.99
25189340--25189406
23
3.2
23
60
24
56
23
26
23
25
2.00
25190769--25190877
37
2.9
37
95
0
191
26
31
19
22
1.98
25191084--25191277
47
4.1
47
89
0
280
26
28
10
34
1.90
25191130--25191248
23
5.1
22
62
28
59
23
31
13
31
1.93
25207076--25207162
36
2.4
36
98
0
165
36
17
4
41
1.70
25214127--25214684
49
11.6
49
94
1
893
33
8
28
29
1.86
25214127--25214684
194
2.9
194
94
2
939
33
8
28
29
1.86
25220386--25220442
27
2.2
26
81
6
62
28
17
21
33
1.96
25224515--25224583
20
3.5
20
87
0
102
30
24
21
23
1.99
25224507--25224583
40
1.9
40
89
0
118
28
24
23
23
1.99
25225863--25225934
23
3.1
23
80
4
83
31
4
1
62
1.23
25225874--25225956
33
2.5
31
78
16
80
30
4
2
62
1.28
25232371--25232570
101
2.0
101
85
1
267
28
26
19
26
1.99
25234536--25234635
50
2.0
50
100
0
200
26
24
18
32
1.97
25238436--25238669
49
4.7
49
82
3
288
28
25
19
26
1.99
25238449--25238680
100
2.3
98
85
2
302
28
26
18
26
1.98
25239328--25239388
30
2.0
30
84
6
79
31
26
6
36
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25247006--25247552
206
2.7
205
91
0
871
30
17
23
28
1.97
25247510--25247597
43
2.0
44
82
2
106
32
14
28
23
1.94
25248089--25248142
20
2.7
20
91
0
90
29
29
20
20
1.98
25249381--25249498
5
23.6
5
68
12
55
33
5
1
58
1.32
25249359--25249424
24
2.6
25
76
19
66
33
7
1
57
1.36
25249424--25249505
33
2.5
32
78
9
85
31
4
2
60
1.30
25251391--25251423
16
2.1
16
88
5
50
39
0
3
57
1.14
25254278--25254396
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5.0
24
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9
172
27
21
21
29
1.98
25254299--25254395
47
2.1
47
94
3
169
28
19
21
29
1.98
25254454--25254510
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333