Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  190  of  333  ( 39894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62350449--62350489
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2.5
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39
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24
25
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2.0
20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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80
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0.98
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0
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0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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56
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0
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6
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1
0
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2.6
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20
22
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1.98
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2.2
82
82
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20
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28
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2.0
20
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46
23
2
28
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62476964--62477005
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20
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0
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0
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16
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0
57
48
12
24
15
1.78
62486061--62486128
19
3.5
19
76
11
75
32
4
19
44
1.70
62486054--62486128
20
3.8
19
77
10
71
32
6
17
44
1.75
62487572--62487638
32
2.1
32
82
0
80
34
2
10
52
1.51
62489458--62489498
21
2.0
21
100
0
82
31
14
0
53
1.41
62491027--62491063
18
2.1
18
100
0
74
35
10
27
27
1.90
62499178--62499220
21
2.0
22
86
4
61
62
0
25
11
1.29
62500202--62500253
13
4.2
13
76
14
65
36
0
15
48
1.45
62515472--62515828
47
7.8
47
90
5
577
32
10
30
27
1.89
62515472--62515828
133
2.6
138
89
7
537
32
10
30
27
1.89
62515805--62515850
23
2.0
23
95
0
83
30
10
32
26
1.90
62515758--62515897
70
2.0
70
92
0
235
32
10
30
27
1.89
62515828--62516101
47
5.8
47
92
1
431
32
8
30
28
1.87
62515711--62515945
117
2.0
117
93
0
398
31
9
30
27
1.89
62515828--62516103
96
2.9
94
92
2
444
32
8
30
28
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62515625--62516040
213
2.0
203
90
4
643
31
9
30
28
1.89
62516222--62516300
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
62518045--62518147
43
2.4
43
98
0
197
22
16
34
26
1.95
62518129--62518202
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
62518511--62518654
40
3.6
40
81
11
154
25
23
27
22
2.00
62518629--62518785
40
3.9
40
89
0
233
23
21
29
25
1.99
62518948--62518999
25
2.1
25
82
7
61
32
7
28
30
1.85
62522179--62522750
47
12.1
47
93
1
901
32
8
30
28
1.88
62522182--62522748
143
4.0
143
93
0
917
31
8
30
28
1.88
62522869--62522947
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
62527149--62527181
14
2.4
14
94
0
57
42
9
18
30
1.81
62528854--62528898
23
2.0
23
86
0
63
42
0
13
44
1.43
62529588--62529689
50
2.1
49
92
5
170
31
20
22
25
1.98
62531921--62532162
123
2.0
123
82
5
301
30
19
27
22
1.98
62532085--62532218
47
2.8
49
83
5
191
28
20
29
21
1.98
62544015--62544199
79
2.3
81
83
7
227
23
22
27
25
2.00
62544015--62544199
40
4.7
40
84
6
225
23
22
27
25
2.00
62544068--62544232
79
2.1
79
83
6
201
25
21
27
26
1.99
62546031--62546244
39
5.4
39
91
1
338
28
27
23
20
1.99
62546031--62546244
117
1.8
119
93
2
378
28
27
23
20
1.99
62546238--62546369
39
3.4
39
92
4
205
25
26
19
28
1.99
62546032--62546362
78
4.2
80
83
6
324
27
27
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62548774--62549276
126
4.0
126
87
1
715
30
17
14
37
1.89
62548774--62549276
252
2.0
251
91
1
810
30
17
14
37
1.89
62549266--62549331
27
2.4
28
94
5
125
22
15
7
54
1.66
62549410--62549508
51
1.9
51
82
8
121
40
12
0
47
1.41
62558063--62558087
2
12.5
2
100
0
50
48
0
52
0
1.00
62569397--62570042
126
5.1
125
85
4
836
28
16
16
38
1.90
62569397--62570044
251
2.6
251
85
4
862
28
16
16
38
1.90
62570124--62570254
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3.9
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11
101
44
12
1
41
1.51
62570147--62570223
34
2.2
35
88
6
113
41
11
2
44
1.55
62574928--62575122
93
2.1
92
88
4
286
44
4
4
47
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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