Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   

This is table  21  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6319828--6319863
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0
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20
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1.9
18
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11
54
17
8
28
45
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.8
48
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2.5
96
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1.99
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55
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40
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22
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0
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0
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19
25
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.97
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30
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1.97
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28
2.5
29
81
2
83
59
8
13
18
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6497726--6497760
7
5.0
7
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2
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1.00
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94
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0
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1.76
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0
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0
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20
9
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17
2.9
17
77
13
59
29
9
1
58
1.41
6517760--6517830
29
2.4
30
76
6
74
43
7
7
42
1.59
6518325--6518386
30
2.1
30
87
0
88
59
11
3
25
1.46
6520475--6521290
407
2.0
407
99
0
1623
37
11
15
36
1.83
6521337--6521381
24
1.9
24
86
4
65
44
0
0
55
0.99
6522884--6523113
116
2.0
116
98
0
442
36
12
18
32
1.89
6523321--6523359
20
1.9
21
84
5
53
64
2
10
23
1.37
6523270--6523576
3
101.3
3
72
10
196
62
1
8
27
1.34
6523935--6524101
20
8.7
19
70
15
76
64
1
8
25
1.31
6524032--6524231
21
9.3
21
69
17
83
62
1
6
30
1.28
6523897--6524206
3
102.3
3
71
9
184
62
2
7
27
1.34
6523185--6525090
630
3.0
630
96
2
3488
57
6
11
24
1.56
6524662--6524699
20
1.9
19
89
5
58
65
0
7
26
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6524527--6524834
3
101.3
3
72
9
205
62
1
7
27
1.33
6526606--6526887
141
2.0
143
90
2
453
26
21
20
31
1.98
6531174--6531252
28
2.8
28
82
0
95
34
10
25
30
1.89
6537075--6537260
32
5.8
32
73
11
125
62
1
6
28
1.30
6537093--6537256
44
3.6
44
74
12
125
62
1
7
28
1.32
6537204--6537332
32
3.8
32
76
14
114
64
2
6
26
1.31
6537073--6537342
3
91.3
3
71
9
180
62
1
7
28
1.33
6543931--6544001
35
2.0
35
86
0
97
29
23
9
36
1.87
6544537--6544569
10
3.3
10
84
16
50
63
0
0
36
0.95
6544970--6545003
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
6547802--6547842
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
6549748--6549781
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
6555620--6555859
46
5.3
45
84
12
237
36
15
21
27
1.93
6555620--6555822
46
4.3
48
87
9
267
35
15
21
27
1.94
6555554--6555822
98
2.7
98
93
0
448
34
15
22
27
1.94
6555786--6555931
37
4.0
37
93
1
242
36
16
21
24
1.94
6561430--6561454
11
2.3
11
100
0
50
20
20
16
44
1.87
6564793--6564888
31
3.1
31
100
0
192
41
12
19
26
1.87
6568936--6568981
6
7.8
6
92
2
76
15
34
0
50
1.44
6570774--6570838
26
2.5
26
77
5
69
75
16
3
4
1.10
6575577--6575673
31
3.2
30
74
11
90
30
12
16
40
1.85
6575632--6575712
31
2.7
30
75
11
76
25
11
18
44
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6583943--6583974
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
6583943--6583973
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
6590590--6590620
16
1.9
16
100
0
62
64
0
0
35
0.94
6592936--6592969
16
2.1
16
94
0
59
11
35
0
52
1.38
6593837--6593870
11
3.1
11
100
0
68
35
11
8
44
1.72
6595079--6595118
20
2.0
20
85
0
53
50
15
10
25
1.74
6596120--6596170
27
1.9
27
88
4
77
56
9
7
25
1.58
6596714--6596751
18
2.2
17
86
9
51
26
2
15
55
1.54
6601318--6601410
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2.3
40
86
0
132
32
23
20
23
1.98
6601713--6602045
64
5.2
63
70
17
238
46
28
1
23
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333